More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0307 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  100 
 
 
390 aa  794    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  48.95 
 
 
388 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  49.06 
 
 
373 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  49.08 
 
 
386 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  48.43 
 
 
386 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  49.34 
 
 
389 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  49.6 
 
 
390 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  50.93 
 
 
391 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  46.67 
 
 
377 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  47.7 
 
 
371 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  47.57 
 
 
373 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  47.84 
 
 
373 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  45.43 
 
 
391 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  48.25 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  44.65 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  46.87 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  44.62 
 
 
391 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  47.44 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  43.85 
 
 
391 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  47.07 
 
 
380 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  46.07 
 
 
370 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  43.85 
 
 
391 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  43.58 
 
 
391 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  43.58 
 
 
391 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  43.58 
 
 
391 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  45.16 
 
 
408 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  43.05 
 
 
391 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  43.05 
 
 
391 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  44.95 
 
 
398 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  43.8 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  43.95 
 
 
390 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  46.63 
 
 
389 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  42.93 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  43.67 
 
 
380 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  43.6 
 
 
851 aa  316  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.93 
 
 
369 aa  315  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  41.01 
 
 
380 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  41.07 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  43.01 
 
 
388 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.68 
 
 
406 aa  305  6e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.11 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  39.68 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.49 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  43.47 
 
 
379 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  41.6 
 
 
433 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.32 
 
 
378 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  40.44 
 
 
395 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  39.52 
 
 
379 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  39.57 
 
 
380 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  40.53 
 
 
441 aa  296  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.05 
 
 
382 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.16 
 
 
387 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  39.25 
 
 
384 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  41.85 
 
 
395 aa  292  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  41.46 
 
 
364 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  42.08 
 
 
811 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.41 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  40.83 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  39.9 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  40.92 
 
 
364 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.38 
 
 
389 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  39.12 
 
 
389 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.6 
 
 
395 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.86 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.27 
 
 
384 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.88 
 
 
411 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  41.19 
 
 
375 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  40 
 
 
369 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.6 
 
 
395 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  42.08 
 
 
849 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.9 
 
 
844 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.7 
 
 
421 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  37.97 
 
 
381 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.02 
 
 
387 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  39.68 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.5 
 
 
434 aa  262  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  38.81 
 
 
417 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  34.76 
 
 
375 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  33.51 
 
 
393 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  38.59 
 
 
437 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  35.9 
 
 
382 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  37.99 
 
 
374 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.73 
 
 
379 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  38.99 
 
 
384 aa  257  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  36.56 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.79 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  37.83 
 
 
397 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  37.67 
 
 
375 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  37.47 
 
 
380 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  39.19 
 
 
367 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.19 
 
 
398 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  37.74 
 
 
371 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  36.78 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>