More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0975 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  100 
 
 		 373 aa  754    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  42.22 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  42.22 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  39.74 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  39.68 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  42.26 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  39.52 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  39.37 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.99 
 
 		 370 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  38.79 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  39.05 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.79 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.77 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.79 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  38.79 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.94 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  38.89 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  40.38 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.26 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.26 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  41.47 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  37.99 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  39.67 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  40.11 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.33 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  37.73 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  37.2 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  37.2 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.19 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  35.29 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  35.25 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  35.71 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  35.71 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.79 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  37.63 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.27 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  34.82 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.68 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  41.18 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  36.36 
 
 		 379 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  36.22 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.04 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.16 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.33 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  35.79 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  39.18 
 
 		 822 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.37 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.68 
 
 		 395 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  37.7 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.37 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  34.32 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  34.11 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.11 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.11 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.11 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  36.1 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.11 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.22 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  34.97 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.93 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.56 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  34.84 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  32.88 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  33.86 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.42 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  33.59 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.66 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.66 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.38 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  36.02 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.48 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.19 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  34.53 
 
 		 851 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  33.52 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  34.33 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  34.49 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  30.87 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  32.75 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  33.69 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.14 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.56 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.33 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.97 
 
 		 842 aa  185  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  34.69 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  32.52 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  33.69 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  36.39 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  32.35 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  32.35 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  32.35 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  35.09 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  34.22 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3032  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.61 
 
 		 817 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.429122  normal  0.0119577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  33.6 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.78 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.78 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  30.95 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.33 
 
 		 834 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  33.24 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  33.33 
 
 		 366 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>