More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0267 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  100 
 
 		 376 aa  776    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  49.19 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  47.35 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  42.59 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  43.35 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.02 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  40.8 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  42.86 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  42.09 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  41.82 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  42.32 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  39.21 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  38.2 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  37.17 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  38.32 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  35.66 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  35.66 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  35.81 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  37.82 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  37.56 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  37.96 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.16 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  37.96 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  37.96 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.18 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.77 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.76 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  37.7 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  37.7 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.97 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.7 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  37.7 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  38.24 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.5 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.34 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  32.53 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.51 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.37 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.47 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  35.88 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  34.05 
 
 		 851 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.43 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.22 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.65 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.66 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  33.16 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.63 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.42 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.6 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  33.87 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.68 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  32.88 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.89 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  34.69 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.87 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.95 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.81 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  35.62 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  36.02 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.6 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  33.69 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.47 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  33.24 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  30.59 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  32.02 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  32.8 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  31.47 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  34.55 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  31.4 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  32.02 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  30.87 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.72 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  32.7 
 
 		 375 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  32.99 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  30.5 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  33.16 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  31.78 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  33.24 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  33.51 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.55 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  32.72 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  35.56 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  32.55 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  31.94 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.83 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.33 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  30.93 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  31.68 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  31.41 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  33.07 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  33.95 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>