More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2736 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  100 
 
 		 356 aa  728    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  42.02 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  36.34 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  37.91 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  37.5 
 
 		 384 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  37.77 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.34 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.06 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  36.66 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.52 
 
 		 370 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  34.72 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36.22 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.88 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.37 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.56 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.66 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.3 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.97 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  35.79 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.71 
 
 		 392 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.51 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.58 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.29 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.51 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  33.06 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  36.76 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  35.36 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.97 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.78 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.15 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  33.15 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  34.71 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  35.42 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.25 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.5 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  33.88 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.01 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  35.26 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  35.77 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.77 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  30.54 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  34.89 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  31 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.61 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.69 
 
 		 842 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  33.52 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.42 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  33.15 
 
 		 380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  32.79 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  32 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  32.32 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  32.13 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.53 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  31.03 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  32.35 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  34.54 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  31 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  34.5 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  33.33 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  30.29 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.51 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0159  alanine racemase  32.56 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0325  alanine racemase  31.87 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  28.61 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  28.89 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  33.51 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.71 
 
 		 403 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  33.52 
 
 		 375 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  31.96 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.06 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  31.79 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.44 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  33.97 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.7 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.77 
 
 		 851 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  32.97 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  28.61 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  31.45 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  31.78 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  30 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  33.24 
 
 		 356 aa  186  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  34.14 
 
 		 375 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  28.07 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.87 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  31.61 
 
 		 441 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  32.08 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.52 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  31.15 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  33.61 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  33.42 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  32.05 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.35 
 
 		 822 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  31.96 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  31.96 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>