More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3073 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  100 
 
 		 378 aa  729    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  62.89 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  64.02 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  55.17 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  52.85 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  56 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  53.62 
 
 		 417 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  55.47 
 
 		 372 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  54.7 
 
 		 441 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  51.96 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  56.22 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  53.62 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  56.18 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  51.99 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  55.14 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  53.19 
 
 		 375 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  53.21 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  55.32 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  55.32 
 
 		 378 aa  308  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  51.34 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  52.12 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  50.13 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  49.46 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  52.42 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  48.63 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  45.7 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  47.71 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  44.77 
 
 		 459 aa  280  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  43.88 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  43.88 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  46.93 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  43.88 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  46.28 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  45.38 
 
 		 402 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  46.88 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  48.77 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.33 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  48.78 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.95 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  47.41 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  33.16 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  44.44 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.42 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  33.42 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  38.46 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  46.05 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  38.01 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.96 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.43 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.88 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40.58 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.9 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.05 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.43 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.97 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.15 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.88 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.88 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.88 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.27 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  38.07 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.15 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.24 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  34.21 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.97 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.88 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.12 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.61 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  32.79 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  32.79 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.46 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.33 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.17 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.43 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.6 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  32.26 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  41.25 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.87 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.84 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.66 
 
 		 395 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.47 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  41.99 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  39.73 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.63 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  35.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.88 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.17 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  31.89 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  30.54 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.79 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.07 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.97 
 
 		 851 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.25 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.64 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.24 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.97 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.34 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.17 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  33.33 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.98 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>