More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1095 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  100 
 
 		 379 aa  776    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  43.47 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  42.55 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  42.4 
 
 		 389 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  40.8 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  41.82 
 
 		 379 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.93 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  39.2 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.93 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  38.48 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.36 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.36 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.93 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  40 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  40.58 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  43.09 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  43.62 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  38.22 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.33 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  37.43 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  38.67 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.87 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  38.99 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  40.37 
 
 		 372 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.89 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  37.33 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  39.62 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  39.3 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  38.44 
 
 		 370 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.81 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  39.73 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  36.8 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.81 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  38.89 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  40.64 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  39.84 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.66 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  36.12 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.67 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  38.3 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.74 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.67 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  37.47 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  35.73 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.07 
 
 		 434 aa  240  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.44 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.24 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  37.5 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.17 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  36.8 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.28 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  35.73 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.73 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  36.12 
 
 		 851 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36.02 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36.02 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  33.77 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.22 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36.13 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.52 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  36.6 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.23 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  39.19 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.11 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  36.05 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  36.05 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  36.05 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  36.89 
 
 		 811 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  37.93 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  33.42 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.48 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.95 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  34.72 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  34.67 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  36.8 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  34.56 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.41 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  34.83 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  35.11 
 
 		 369 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  34.3 
 
 		 379 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.87 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.66 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  35.39 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.46 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  35.48 
 
 		 842 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.88 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  35.11 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  34.55 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  34.64 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  32.98 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.88 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  35.45 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  35.11 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.42 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  35.62 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  32.9 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.16 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.84 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.84 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.84 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>