More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0990 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  100 
 
 		 397 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  58.66 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  58.81 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  59.06 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  56.46 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  56.08 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  54.97 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  54.45 
 
 		 372 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  53.66 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  51.02 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  51.96 
 
 		 378 aa  348  8e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  52.37 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  53.16 
 
 		 381 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  52.85 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  53.42 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  56.2 
 
 		 374 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  53.37 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  53.51 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  51.83 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  48.67 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  51.76 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  50.52 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  50.13 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  48.93 
 
 		 441 aa  305  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  48.18 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  46.35 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  49.34 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  49.46 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  45.41 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  45.36 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  45.36 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  45.36 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  47.88 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  46.68 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  41.87 
 
 		 459 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  41.76 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  47.03 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  49.01 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  41.84 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  43.1 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.64 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  37.83 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.03 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  44.56 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  40.85 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.17 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.09 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  46.15 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  40.76 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  44.08 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  35.34 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.91 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.44 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.17 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.22 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.22 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.95 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.69 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.95 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.39 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.64 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.64 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.69 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.39 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.69 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  36.7 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.33 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.93 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.03 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.24 
 
 		 378 aa  229  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  41.6 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.31 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  36.6 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  41.51 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  37.14 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.78 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  38.36 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.72 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  37.02 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.1 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  40.9 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  35.49 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  40.53 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.43 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.63 
 
 		 851 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.18 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  36.25 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  35.45 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  38.23 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.23 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.66 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.95 
 
 		 395 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.74 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.01 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.17 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.63 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.86 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  35.86 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  35.86 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>