More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2520 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  52.93 
 
 
844 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  48 
 
 
851 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  54.78 
 
 
849 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  100 
 
 
811 aa  1602    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  48.63 
 
 
373 aa  319  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  42.08 
 
 
390 aa  303  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  41.03 
 
 
391 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  302  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  40.76 
 
 
391 aa  302  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  40.76 
 
 
391 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  300  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  299  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  299  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  46.65 
 
 
390 aa  299  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  42.01 
 
 
388 aa  299  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  40.49 
 
 
391 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.76 
 
 
392 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  40.22 
 
 
373 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  40.49 
 
 
373 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  44.96 
 
 
373 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  43.72 
 
 
391 aa  294  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  40.49 
 
 
373 aa  293  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  42.9 
 
 
389 aa  291  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  43.01 
 
 
371 aa  287  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.13 
 
 
380 aa  286  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  43.17 
 
 
379 aa  286  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  40.71 
 
 
386 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  40.76 
 
 
408 aa  282  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  42.82 
 
 
370 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  40.44 
 
 
386 aa  281  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  40.5 
 
 
370 aa  279  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  42.15 
 
 
403 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.87 
 
 
390 aa  277  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  40.65 
 
 
398 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  43.29 
 
 
380 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  39.07 
 
 
390 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  41.64 
 
 
369 aa  271  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  39.3 
 
 
377 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  42.74 
 
 
378 aa  267  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  40.11 
 
 
389 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.11 
 
 
395 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  39.7 
 
 
395 aa  264  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  45.65 
 
 
384 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.77 
 
 
403 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  44.66 
 
 
393 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  42.01 
 
 
389 aa  257  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  39.3 
 
 
384 aa  257  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.5 
 
 
403 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  40.05 
 
 
441 aa  256  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  43.99 
 
 
380 aa  255  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  42.3 
 
 
375 aa  255  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  39.46 
 
 
379 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  254  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  41.73 
 
 
389 aa  254  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  41.37 
 
 
395 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  41.46 
 
 
389 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  41.46 
 
 
389 aa  250  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  41.1 
 
 
395 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  41.98 
 
 
388 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  41.35 
 
 
389 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  44.47 
 
 
397 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  40.82 
 
 
395 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.6 
 
 
406 aa  248  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.92 
 
 
389 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.51 
 
 
387 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  39.9 
 
 
433 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  36.89 
 
 
379 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  40.87 
 
 
376 aa  240  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  38.96 
 
 
364 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  39.08 
 
 
382 aa  238  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.52 
 
 
380 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.99 
 
 
387 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  46.58 
 
 
365 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.68 
 
 
379 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.41 
 
 
379 aa  230  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  38.2 
 
 
411 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.43 
 
 
395 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  41.67 
 
 
408 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  26.93 
 
 
823 aa  226  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  36.24 
 
 
369 aa  225  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.47 
 
 
375 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  40 
 
 
402 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.23 
 
 
434 aa  222  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.02 
 
 
376 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  36.07 
 
 
421 aa  220  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  36.8 
 
 
384 aa  219  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  25.2 
 
 
834 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  37.33 
 
 
381 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.94 
 
 
375 aa  217  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  40.2 
 
 
405 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  24.64 
 
 
842 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  24.23 
 
 
822 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  37.8 
 
 
398 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  39.45 
 
 
372 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  38.74 
 
 
376 aa  210  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>