More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  100 
 
 		 412 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  70.63 
 
 		 410 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  59.84 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  63.14 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  61.56 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  57.7 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  56.54 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  54.26 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  52.85 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  52.58 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  49.88 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  52.45 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  52.31 
 
 		 437 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  54.64 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  54.43 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  53.63 
 
 		 375 aa  342  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  55.15 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  52.58 
 
 		 372 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  52.58 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  54.03 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  50 
 
 		 450 aa  330  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  55.75 
 
 		 415 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  51.04 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  54.59 
 
 		 378 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  47.92 
 
 		 408 aa  308  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  51.57 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  54.45 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  46.61 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  46.61 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  46.61 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  46.98 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  47.8 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  48.05 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  50.52 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  45.71 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  47.16 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  48.18 
 
 		 380 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  50.78 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  45.43 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  45.81 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  40.41 
 
 		 370 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.1 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.19 
 
 		 371 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  31.09 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  31.71 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.59 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.1 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  38.89 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.25 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.85 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.87 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.84 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.85 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.59 
 
 		 391 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.09 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.85 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.63 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.85 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.9 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  33.85 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.59 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  42.63 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.25 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.66 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.66 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.92 
 
 		 373 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.18 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  33.67 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.25 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.64 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.9 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.4 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.17 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  32.39 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  38.23 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.47 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  32.81 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  32.13 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.57 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  37.7 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.03 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.67 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.81 
 
 		 395 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.55 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.48 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.11 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.84 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.24 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.26 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.18 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  37.86 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.08 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.29 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  36.88 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.11 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  37.66 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  37.66 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.01 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  39.74 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  32.22 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>