More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1132 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  100 
 
 
380 aa  767    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  42.97 
 
 
388 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  46.87 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  47.44 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  43.51 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  45.8 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  44.24 
 
 
391 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  42.78 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  43.24 
 
 
373 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  43.94 
 
 
373 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  39.57 
 
 
390 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  43.48 
 
 
370 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  42.33 
 
 
390 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  44.09 
 
 
370 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  40.97 
 
 
386 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.36 
 
 
380 aa  285  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  40.97 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  42.47 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  40.82 
 
 
390 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  39.14 
 
 
391 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  43.9 
 
 
369 aa  275  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  38.87 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  42.25 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  39.57 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  39.3 
 
 
391 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  41.33 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  39.57 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  39.02 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  39.3 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  41.89 
 
 
378 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.3 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  45.26 
 
 
380 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.3 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  39.02 
 
 
391 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  40 
 
 
389 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  42.13 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  39.41 
 
 
408 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  43.62 
 
 
851 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.75 
 
 
382 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.27 
 
 
384 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  40.75 
 
 
433 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  43.29 
 
 
811 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  43.8 
 
 
388 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  38.34 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  40.91 
 
 
390 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  40 
 
 
441 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  36.39 
 
 
369 aa  250  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.13 
 
 
398 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  37.87 
 
 
395 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  46.85 
 
 
844 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  44.11 
 
 
849 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  40.37 
 
 
367 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.62 
 
 
403 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.1 
 
 
389 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.31 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.89 
 
 
403 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.96 
 
 
403 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  38.5 
 
 
389 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  38.48 
 
 
364 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  41.41 
 
 
397 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.56 
 
 
387 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  40.43 
 
 
379 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.89 
 
 
375 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  40 
 
 
384 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  40.43 
 
 
379 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  38.4 
 
 
434 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.21 
 
 
395 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  38.24 
 
 
389 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  37.7 
 
 
389 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  225  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  37.67 
 
 
395 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  37.04 
 
 
389 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  37.67 
 
 
395 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.79 
 
 
382 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.7 
 
 
378 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  38.75 
 
 
393 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  35.69 
 
 
375 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  36.76 
 
 
421 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.61 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.78 
 
 
395 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.48 
 
 
379 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  38.95 
 
 
384 aa  219  8.999999999999998e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  36.99 
 
 
367 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  35.22 
 
 
399 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  33.6 
 
 
399 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  34.22 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  35.34 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  39.62 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.98 
 
 
399 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  36.02 
 
 
365 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  35.25 
 
 
366 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  33.24 
 
 
376 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  34.05 
 
 
399 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.7 
 
 
374 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  38.27 
 
 
408 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>