More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0159 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0159  alanine racemase  100 
 
 
372 aa  733    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  33.7 
 
 
356 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.89 
 
 
369 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  29.03 
 
 
411 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  30.03 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.7 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  30.55 
 
 
379 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  28.14 
 
 
378 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  29.92 
 
 
382 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  30.33 
 
 
376 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.63 
 
 
378 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  28.18 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  28.18 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  30.62 
 
 
374 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  27.51 
 
 
382 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  28.57 
 
 
379 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  28.11 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  29.23 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  28.8 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  26.54 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  29.46 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  30.16 
 
 
371 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  34.82 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  27.2 
 
 
373 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  29.75 
 
 
365 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  29.31 
 
 
400 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  26.8 
 
 
370 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  25 
 
 
366 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  30.98 
 
 
390 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  25.47 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  26.45 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  29.02 
 
 
379 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  28.65 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  30.69 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  27.54 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  28.76 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  24.6 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  30.6 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  26.4 
 
 
398 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  29.11 
 
 
359 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.05 
 
 
380 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  26.88 
 
 
392 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  25.9 
 
 
377 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  29.86 
 
 
376 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  29.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  26.43 
 
 
355 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  28.84 
 
 
359 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  29.11 
 
 
359 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  30.6 
 
 
373 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  22.55 
 
 
378 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  29.04 
 
 
366 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.15 
 
 
373 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  25.6 
 
 
388 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  28.42 
 
 
359 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  29.43 
 
 
384 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  28.25 
 
 
367 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  28.42 
 
 
359 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  28.42 
 
 
359 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  28.07 
 
 
391 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  28.42 
 
 
359 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  28.42 
 
 
359 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  30.08 
 
 
364 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  27.55 
 
 
375 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  28.25 
 
 
372 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  26.34 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  29.32 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  32.77 
 
 
343 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  26.34 
 
 
391 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  26.27 
 
 
357 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  20.7 
 
 
402 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  29.81 
 
 
364 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  25.59 
 
 
405 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  26.22 
 
 
380 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  28.89 
 
 
387 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  24.72 
 
 
367 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  22.97 
 
 
384 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  26.34 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  26.08 
 
 
391 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  26.08 
 
 
391 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  31.51 
 
 
386 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  28.53 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  31.51 
 
 
386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  28.53 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  26.08 
 
 
391 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  26.08 
 
 
391 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  32.05 
 
 
364 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  25.88 
 
 
391 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  24.93 
 
 
387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  25.88 
 
 
391 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  30.11 
 
 
389 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  26.49 
 
 
375 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  26.43 
 
 
408 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  27.08 
 
 
375 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  24.46 
 
 
371 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  21.16 
 
 
415 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>