More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1318 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  42.4 
 
 		 823 aa  663    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3032  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  45.33 
 
 		 817 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.429122  normal  0.0119577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4988  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  43.38 
 
 		 824 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  43.98 
 
 		 835 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  100 
 
 		 822 aa  1672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  45.78 
 
 		 842 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  47.89 
 
 		 834 aa  757    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  48.36 
 
 		 368 aa  362  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0034  alanine racemase  47.4 
 
 		 369 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  25.93 
 
 		 851 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.39 
 
 		 390 aa  229  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  36.07 
 
 		 398 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  38.61 
 
 		 388 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  37.53 
 
 		 380 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  39.18 
 
 		 373 aa  211  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.33 
 
 		 369 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.67 
 
 		 391 aa  208  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.05 
 
 		 395 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.84 
 
 		 377 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.8 
 
 		 390 aa  207  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.22 
 
 		 373 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  24.23 
 
 		 811 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.22 
 
 		 391 aa  204  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.13 
 
 		 391 aa  204  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.13 
 
 		 391 aa  204  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.68 
 
 		 379 aa  204  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.5 
 
 		 395 aa  204  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.67 
 
 		 391 aa  203  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  34.67 
 
 		 391 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  31.97 
 
 		 402 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  33.51 
 
 		 378 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.44 
 
 		 441 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.68 
 
 		 411 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.56 
 
 		 373 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  34.13 
 
 		 391 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.24 
 
 		 392 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  24.19 
 
 		 844 aa  201  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.2 
 
 		 380 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.7 
 
 		 371 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.87 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.87 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  32.98 
 
 		 390 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  29.62 
 
 		 421 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.7 
 
 		 403 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.69 
 
 		 408 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  34.85 
 
 		 389 aa  197  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  33.15 
 
 		 376 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  32.04 
 
 		 388 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.78 
 
 		 379 aa  195  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.74 
 
 		 391 aa  195  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.68 
 
 		 389 aa  195  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.25 
 
 		 403 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  33.42 
 
 		 388 aa  193  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  33.16 
 
 		 373 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.23 
 
 		 370 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  33.96 
 
 		 387 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.72 
 
 		 390 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  33.88 
 
 		 375 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  33.6 
 
 		 396 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.8 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.08 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  33.6 
 
 		 373 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.76 
 
 		 370 aa  191  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  35.45 
 
 		 364 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.73 
 
 		 433 aa  190  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  31.83 
 
 		 382 aa  190  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  30.93 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.97 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.6 
 
 		 369 aa  189  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  33.6 
 
 		 358 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  35.03 
 
 		 364 aa  189  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  33.51 
 
 		 383 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  36.7 
 
 		 386 aa  187  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  23.99 
 
 		 849 aa  187  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  32.08 
 
 		 383 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  32.08 
 
 		 383 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  32.08 
 
 		 383 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  32.63 
 
 		 379 aa  187  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  32.63 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  36.41 
 
 		 386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  32.71 
 
 		 397 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  31.93 
 
 		 379 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  32.52 
 
 		 369 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  31.9 
 
 		 381 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  32.8 
 
 		 382 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  31.27 
 
 		 375 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  34.35 
 
 		 356 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.84 
 
 		 399 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  31.2 
 
 		 384 aa  182  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  31.28 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  30.24 
 
 		 406 aa  182  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  32.8 
 
 		 390 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  29.93 
 
 		 408 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.53 
 
 		 374 aa  181  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  31.68 
 
 		 405 aa  180  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  34.23 
 
 		 399 aa  180  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  29.37 
 
 		 434 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  31.07 
 
 		 378 aa  178  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.07 
 
 		 395 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  31.7 
 
 		 384 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>