More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2981 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  100 
 
 
844 aa  1641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  50.41 
 
 
851 aa  776    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  78.55 
 
 
849 aa  1174    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  53.16 
 
 
811 aa  767    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  42.9 
 
 
390 aa  306  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  46.49 
 
 
371 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  48.5 
 
 
373 aa  302  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  41.14 
 
 
373 aa  302  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  41.42 
 
 
373 aa  297  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  43.13 
 
 
388 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  41.42 
 
 
373 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  44.57 
 
 
370 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  45.08 
 
 
389 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  44.35 
 
 
373 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  45.08 
 
 
389 aa  292  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  45.36 
 
 
389 aa  292  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  39.04 
 
 
380 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  43.63 
 
 
391 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  45.36 
 
 
389 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  44.81 
 
 
389 aa  290  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  47.81 
 
 
384 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  44.81 
 
 
389 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  44.81 
 
 
389 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  44.81 
 
 
389 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  44.81 
 
 
389 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  42.42 
 
 
370 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  44.54 
 
 
389 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  46.85 
 
 
380 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.7 
 
 
392 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  42.55 
 
 
389 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  42.08 
 
 
379 aa  283  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  45.08 
 
 
389 aa  283  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  44.53 
 
 
390 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  43.44 
 
 
387 aa  281  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  45.45 
 
 
378 aa  280  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  39.62 
 
 
391 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  40.16 
 
 
391 aa  277  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  39.62 
 
 
391 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  40.16 
 
 
391 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  39.62 
 
 
391 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  39.08 
 
 
391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  39.35 
 
 
391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  40.65 
 
 
377 aa  275  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  40.44 
 
 
386 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.89 
 
 
386 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.81 
 
 
391 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.81 
 
 
391 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  41.1 
 
 
395 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  41.32 
 
 
403 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  43.75 
 
 
369 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  38.19 
 
 
390 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  43.88 
 
 
390 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  44.54 
 
 
375 aa  265  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  40.43 
 
 
408 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  39.89 
 
 
398 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  41.03 
 
 
389 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.87 
 
 
403 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.6 
 
 
403 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  43.01 
 
 
441 aa  258  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  46.44 
 
 
388 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.42 
 
 
395 aa  255  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  27.92 
 
 
823 aa  254  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  26.18 
 
 
834 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  44.11 
 
 
380 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  43.67 
 
 
433 aa  247  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  24.52 
 
 
822 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.81 
 
 
384 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  42.86 
 
 
395 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  41.26 
 
 
376 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  41.24 
 
 
380 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  43.13 
 
 
395 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  45.04 
 
 
393 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.87 
 
 
406 aa  240  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3032  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  26.33 
 
 
817 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.429122  normal  0.0119577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  39.68 
 
 
421 aa  239  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  49.3 
 
 
365 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  38.42 
 
 
369 aa  237  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  42.58 
 
 
395 aa  237  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  39.84 
 
 
364 aa  236  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  39.2 
 
 
434 aa  235  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.27 
 
 
379 aa  234  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  39.63 
 
 
387 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  39.95 
 
 
411 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.11 
 
 
382 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  43.01 
 
 
376 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  24.04 
 
 
842 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  35.6 
 
 
374 aa  225  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  43.82 
 
 
397 aa  223  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  37.57 
 
 
398 aa  224  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.7 
 
 
395 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  37.07 
 
 
381 aa  221  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  37.67 
 
 
366 aa  221  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  34.48 
 
 
399 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4988  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  25.4 
 
 
824 aa  218  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  41.32 
 
 
372 aa  217  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.35 
 
 
399 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  34.83 
 
 
402 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  42.94 
 
 
388 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  42.93 
 
 
405 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  33.96 
 
 
399 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>