More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1097 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  100 
 
 		 823 aa  1691    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4988  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  44.88 
 
 		 824 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  45.65 
 
 		 835 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  42.4 
 
 		 822 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  44.22 
 
 		 842 aa  683    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3032  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  44.07 
 
 		 817 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.429122  normal  0.0119577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  46.13 
 
 		 834 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  40.66 
 
 		 368 aa  293  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  28.67 
 
 		 851 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0034  alanine racemase  36.93 
 
 		 369 aa  261  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  36.1 
 
 		 390 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37 
 
 		 391 aa  224  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  26.93 
 
 		 811 aa  221  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  27.71 
 
 		 844 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.13 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.83 
 
 		 389 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  37.64 
 
 		 369 aa  206  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.47 
 
 		 388 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  33.78 
 
 		 373 aa  205  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  36.14 
 
 		 373 aa  205  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.49 
 
 		 379 aa  204  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  26.08 
 
 		 849 aa  203  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.33 
 
 		 373 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  35.62 
 
 		 380 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.68 
 
 		 392 aa  202  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.7 
 
 		 370 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  35.62 
 
 		 371 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.42 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  34.39 
 
 		 374 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  36.63 
 
 		 373 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.83 
 
 		 377 aa  197  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  33.85 
 
 		 389 aa  195  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  35.97 
 
 		 364 aa  194  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.96 
 
 		 391 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  35.6 
 
 		 380 aa  194  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.41 
 
 		 391 aa  193  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.95 
 
 		 378 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.96 
 
 		 386 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.78 
 
 		 403 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.42 
 
 		 391 aa  191  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  34.33 
 
 		 369 aa  191  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.96 
 
 		 391 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.41 
 
 		 391 aa  191  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  33.69 
 
 		 391 aa  190  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.33 
 
 		 395 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.15 
 
 		 386 aa  190  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.42 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.22 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.15 
 
 		 397 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.42 
 
 		 391 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.97 
 
 		 370 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  34.44 
 
 		 356 aa  189  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.42 
 
 		 391 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  38.65 
 
 		 380 aa  189  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.75 
 
 		 390 aa  187  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.14 
 
 		 441 aa  187  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  36.15 
 
 		 380 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  32.26 
 
 		 390 aa  183  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  33.69 
 
 		 421 aa  183  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  35.09 
 
 		 382 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.11 
 
 		 403 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  35.11 
 
 		 384 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.87 
 
 		 408 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  33.51 
 
 		 384 aa  180  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.46 
 
 		 403 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.43 
 
 		 395 aa  179  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.13 
 
 		 379 aa  178  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  32.43 
 
 		 395 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.19 
 
 		 411 aa  177  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  30.96 
 
 		 369 aa  177  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.43 
 
 		 395 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  33.42 
 
 		 364 aa  177  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  32.6 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  32.47 
 
 		 396 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.97 
 
 		 395 aa  174  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  34.99 
 
 		 364 aa  174  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  33.33 
 
 		 355 aa  173  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  32.98 
 
 		 376 aa  173  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  30.87 
 
 		 356 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  34.31 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  30.87 
 
 		 375 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.42 
 
 		 378 aa  172  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  33.15 
 
 		 393 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  30.85 
 
 		 434 aa  171  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  32.88 
 
 		 365 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  34.04 
 
 		 379 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  33.24 
 
 		 373 aa  171  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  33.97 
 
 		 367 aa  169  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  35.23 
 
 		 361 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  34.07 
 
 		 356 aa  169  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  33.78 
 
 		 364 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  33.78 
 
 		 364 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.55 
 
 		 379 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  32.88 
 
 		 358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  35.41 
 
 		 357 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  31.13 
 
 		 364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  32.33 
 
 		 357 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  32.33 
 
 		 357 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.9 
 
 		 433 aa  165  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  33.86 
 
 		 388 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>