More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1093 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  100 
 
 		 373 aa  774    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  49.45 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  48.8 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  48.8 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  45.84 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  46.89 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  44.48 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  42.94 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  42.09 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  46.5 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  42.37 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  44.76 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  41.78 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  43.06 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  40.22 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  40.92 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  39.45 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  42.21 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  40.39 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  40.76 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  38.67 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  39.23 
 
 		 413 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  38.68 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  38.4 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  38.61 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  37.26 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  39.72 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  40.4 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  37.54 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  39.9 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  40.49 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  40.23 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  39.94 
 
 		 342 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  42.74 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  39.55 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  39.83 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  38.89 
 
 		 423 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  36.68 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  38.1 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  40.17 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  36.9 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  37.23 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  38.06 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  38.06 
 
 		 349 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  41.48 
 
 		 294 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  38.06 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  37.43 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  37.05 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  34.78 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.26 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  35.23 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  36.44 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.8 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  31.42 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  30.62 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  34.07 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  31.47 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  32.7 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  34.25 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  29.83 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  29.95 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  31.46 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  33.33 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  33.79 
 
 		 851 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  34.24 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  34.16 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  31.78 
 
 		 391 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  29.12 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  33.71 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  33.33 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  33.33 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  30.73 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.6 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.44 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  33.43 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.37 
 
 		 834 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  33.61 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  30.33 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  32.04 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  29.76 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  34.35 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  34.65 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  32.04 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  30.21 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  29.03 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  30.75 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  31.98 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  33.06 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  32.49 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  30.52 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.05 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  31.54 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  31.51 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  31.2 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.07 
 
 		 842 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  31.1 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  33.6 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  29.41 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  33.51 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>