More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1812 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  100 
 
 		 373 aa  770    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  42.2 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  38.92 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.24 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  35.71 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  40.87 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  40.87 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  36.04 
 
 		 389 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  36.86 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  38.21 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  36.39 
 
 		 389 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  36.59 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.31 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  39.84 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  36.86 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.3 
 
 		 386 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  37.87 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  36.12 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  35.83 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  32.53 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  34.24 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.45 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  36.24 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  35.19 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  36.41 
 
 		 388 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.37 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.92 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.9 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.37 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  35.11 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  34.84 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  34.84 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.11 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  33.88 
 
 		 373 aa  205  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.11 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.71 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.73 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.85 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.22 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.75 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.49 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.85 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.67 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  34.4 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  32.1 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  37.67 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.16 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.58 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.47 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  35.68 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.15 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  32.7 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.12 
 
 		 851 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.62 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  34.55 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.39 
 
 		 395 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.78 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.88 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  36.14 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.86 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  35.68 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.44 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.74 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.26 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.86 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  33.95 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.83 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  35.29 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.36 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  32.35 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.16 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.6 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.13 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36.75 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  32.79 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.97 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.79 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  36.01 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.32 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  35.37 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.08 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  33.16 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  32.8 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.6 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.39 
 
 		 384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.41 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  32.53 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  34.05 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  35.04 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  33.07 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  32.37 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  35.87 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  31.37 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.03 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  32.7 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>