More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1739 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  100 
 
 		 342 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  63.74 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  62.87 
 
 		 349 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  62.87 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  60.82 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  57.27 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  57.99 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  46.26 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  46.07 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  46.67 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.41 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  45.48 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  43.98 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  41.13 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  41.27 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  43.02 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  41.13 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  43.47 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  42.9 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  43.42 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  39.55 
 
 		 409 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  40.98 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  42.86 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  41 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  36.9 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  41.1 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  44.48 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  40.56 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.13 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  43.57 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  41.62 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  41.39 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  40.06 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  39.84 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  42.18 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  39.34 
 
 		 413 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  41.89 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  40.92 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  40.88 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  41.06 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  42.78 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  41.93 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  43.02 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  39.01 
 
 		 388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  40.96 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  42.53 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  38.55 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  39.38 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  36.61 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  33.24 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  39.94 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  35.34 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  33.14 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  32.01 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.08 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  32.66 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  36.34 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  32.86 
 
 		 375 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.14 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  32.29 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  33.52 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  35.36 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  34.67 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  35.24 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  32.67 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  31.16 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  32.2 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  34.86 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  31.87 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  40.36 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  32.65 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  34.56 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  32.52 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  34.18 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  34.56 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  32.07 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  33.62 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  33.62 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  33.62 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  33.81 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  33.91 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  32.85 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  33.52 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  30.92 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  32.28 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  32.28 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  34.49 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  34.26 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  31.64 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  33.33 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  31.28 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.63 
 
 		 823 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  33.33 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  33.33 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  31.64 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  31.64 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  31.64 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  32.6 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  31.64 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>