More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2506 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  100 
 
 		 360 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  46.65 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  47.04 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  46.83 
 
 		 398 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  43.21 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  43.54 
 
 		 385 aa  265  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  47.24 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  45.13 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  42.62 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  45.33 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  43.72 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  41.81 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  43.02 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  46.11 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  46.78 
 
 		 374 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  45.33 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  37.54 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  44.35 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  45.48 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  45.1 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  43.7 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  40.91 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  42.32 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  40.64 
 
 		 396 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  45.18 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  44.9 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  45.3 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  42.08 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  43.8 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  43.06 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  44.48 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  44.63 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  43.86 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  43.86 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  44.9 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  43.3 
 
 		 345 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  43.37 
 
 		 357 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  45.35 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  42.66 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  46.88 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  42.66 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  39.84 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  42.94 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  38.92 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  37.67 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  46.37 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  40.93 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  39.66 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  43.71 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  37.33 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  35.82 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  38.27 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  35.93 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  42.02 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  35.93 
 
 		 356 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  35.1 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  35.1 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  35.65 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  43.38 
 
 		 294 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  34.82 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  35 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  38.46 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  34.82 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  38.44 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  35.97 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  34.45 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  37.99 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  38.87 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  34.64 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  37.25 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  34.17 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  34.17 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  36.18 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  36.18 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  35.97 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  33.33 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  35.9 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  36.18 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.96 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  36.13 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  34.45 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  36.18 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  36.13 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  36.18 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  36.13 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  37.12 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  36.39 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  33.62 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  38.48 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  38.48 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  33.89 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  35.9 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  37.36 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  34.84 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  33.61 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>