More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0396 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  100 
 
 		 385 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  50.83 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  51.37 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  50.28 
 
 		 387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  42.37 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  47.8 
 
 		 388 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  44.51 
 
 		 380 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  48.5 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  45 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  44.93 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  46.69 
 
 		 378 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  43.2 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  43.2 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  47.99 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  47.99 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.98 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  43.72 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  43.58 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  44.17 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  44.48 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  42.59 
 
 		 389 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  47.06 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  41.89 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  43.85 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  43.96 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  47.58 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  41.58 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.08 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  43.37 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  43.54 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  46.32 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  46.81 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  43.17 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  43.92 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  43.09 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  39.73 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  41.6 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  43.92 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  41.89 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  44.41 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  39.02 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  42.46 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  42.46 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  42.22 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  42.86 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.39 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  40.56 
 
 		 345 aa  213  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  41.64 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  38.87 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  42.09 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  39.15 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.59 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  32.7 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.57 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.15 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.15 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  36.59 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  31.96 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.31 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.96 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.09 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.17 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.53 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.99 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  32.23 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  32.43 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  30.75 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  32.81 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  34.83 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  30.83 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.35 
 
 		 395 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  28.26 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  30 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  32.88 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  33.33 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  33.93 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  32.38 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  33.24 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  35.64 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  32.94 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  31.92 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  31.38 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  33.14 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  30.58 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  32.66 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  30.77 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  29.54 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  31.38 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  32.58 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.1 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  30.3 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  34.52 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  30.03 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  30.5 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.61 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  30.24 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  29.81 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  30.5 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  32.66 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  33.88 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>