More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1349 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1349  alanine racemase  100 
 
 		 372 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  62.26 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  52.69 
 
 		 374 aa  358  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  40.43 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.58 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  38.4 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.74 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  37.04 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  37.33 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  42.18 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  37.13 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.13 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  39.55 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.47 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.68 
 
 		 403 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  36.9 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.41 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  35.77 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  38.18 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  38.18 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  37.7 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  38.18 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.17 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.03 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  37.6 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  37.89 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  35.91 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.15 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  37.61 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  34.68 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.84 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  38.5 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  37.61 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.74 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  37.19 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.52 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.4 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  38.74 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  37.47 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  36.22 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.16 
 
 		 395 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.47 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  31.49 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  35.64 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  34.92 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.42 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.17 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  30.91 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  38.72 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  30.91 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  33.88 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.05 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.17 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.33 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.89 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.17 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  37.46 
 
 		 357 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  35.47 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  35.61 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  36.75 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  30.94 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  36.9 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  35.9 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  36.09 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  30.73 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  36.75 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  36.9 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  36.9 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  36.65 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  36.9 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  36.9 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  36.39 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  36.97 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  31.07 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  31.41 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  31.94 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  36.75 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.22 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  30.91 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  36.75 
 
 		 358 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.1 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  30.81 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  39.02 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.04 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  36.54 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  34.56 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  35.25 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  35.39 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  40.93 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>