More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1004 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  100 
 
 		 402 aa  810    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  37.26 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  33.78 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  33.78 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  33.33 
 
 		 501 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  33.47 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  32.89 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  32.89 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  33.76 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  34.05 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  35.68 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  27.91 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  25.91 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  27.57 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  30.84 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  31.67 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  27.57 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  33.88 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  33.33 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  31.72 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  31.72 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  31 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  31 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  34.13 
 
 		 293 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  30.57 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  30.04 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  24.79 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  33.49 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  37.1 
 
 		 448 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  30.53 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  30.69 
 
 		 463 aa  90.9  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  26.28 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  36.56 
 
 		 448 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  36.56 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  28.53 
 
 		 498 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  34.62 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  28.09 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  29.64 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.97 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  29.49 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.11 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.19 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.55 
 
 		 629 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  25.73 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  33.17 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  32.38 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  31.15 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  34.68 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  29.55 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.16 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  26.35 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.39 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.22 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.05 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  30.73 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.38 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.82 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.27 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.77 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.22 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.95 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.6 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  27.05 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.51 
 
 		 617 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  41.53 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  32.46 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.05 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  41.53 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.01 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.86 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  40.68 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  27.49 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  31.8 
 
 		 781 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.21 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.48 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  26.57 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  27.23 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.26 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.81 
 
 		 613 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  30.69 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  30.69 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  30.53 
 
 		 617 aa  69.7  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.52 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.09 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.94 
 
 		 269 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.58 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  31.41 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  37.17 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.51 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.88 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.42 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.89 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.65 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  27.83 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.51 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.21 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>