More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1546 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  100 
 
 		 445 aa  856    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  43.01 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  43.07 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  36.36 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  40.2 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  35.53 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  44.76 
 
 		 392 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  38.05 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  39.61 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  38.61 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  46.45 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  44.64 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  38.31 
 
 		 433 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  44.21 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  42.81 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  31.77 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  31.77 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  33.05 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  37.5 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  41.44 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  40.22 
 
 		 293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  31.28 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  31.28 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  31.03 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  32.77 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  37.93 
 
 		 323 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  32.77 
 
 		 501 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  32.77 
 
 		 501 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  38.46 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  36.46 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  32.21 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  36.59 
 
 		 301 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  39.19 
 
 		 288 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.64 
 
 		 306 aa  156  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  39.9 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  39.34 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  35.06 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  42.95 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  29.03 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  42.62 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  42.28 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.85 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  40.76 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  38.07 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  35.46 
 
 		 311 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  31.63 
 
 		 781 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  31.25 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.74 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.99 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.5 
 
 		 321 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.24 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.47 
 
 		 290 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.96 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.43 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.43 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.7 
 
 		 298 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.84 
 
 		 313 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.75 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.95 
 
 		 298 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.2 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.48 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.62 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  33.99 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  34.88 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  29.52 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.53 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.95 
 
 		 298 aa  96.7  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  38.82 
 
 		 270 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.52 
 
 		 331 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.98 
 
 		 290 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  33.49 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.39 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  30.77 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.29 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.04 
 
 		 313 aa  93.2  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.34 
 
 		 295 aa  93.2  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.83 
 
 		 320 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.11 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  32.95 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.63 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.54 
 
 		 605 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  34.24 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  31.6 
 
 		 569 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.85 
 
 		 831 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.7 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 265 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.22 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.72 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.72 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  34.22 
 
 		 280 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  27.99 
 
 		 320 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.71 
 
 		 596 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.87 
 
 		 311 aa  90.1  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  34.62 
 
 		 361 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  33.02 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  35.33 
 
 		 360 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.13 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.46 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>