More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2094 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10039  capsid component  98.86 
 
 
439 aa  879    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  98.18 
 
 
439 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  98.86 
 
 
439 aa  879    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  98.18 
 
 
439 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  100 
 
 
439 aa  887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  55.15 
 
 
436 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  52.76 
 
 
501 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  98.01 
 
 
201 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  52.76 
 
 
501 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  52.53 
 
 
501 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  52.77 
 
 
501 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  52.05 
 
 
501 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  51.34 
 
 
498 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  44.82 
 
 
450 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  38.57 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  35.62 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.43 
 
 
288 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  39.85 
 
 
448 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  40.22 
 
 
448 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  33.19 
 
 
481 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  34.3 
 
 
301 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  39.85 
 
 
451 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  38.16 
 
 
416 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  35.86 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.25 
 
 
436 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  35.12 
 
 
461 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.62 
 
 
292 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  35.03 
 
 
410 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  36.21 
 
 
408 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  34.64 
 
 
316 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  34.68 
 
 
433 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  30.79 
 
 
445 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  34.56 
 
 
433 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  40.36 
 
 
418 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  40.71 
 
 
418 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.71 
 
 
392 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  35.63 
 
 
323 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  32.04 
 
 
374 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  34.07 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  40.42 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.44 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  36.87 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  34.09 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  39.9 
 
 
311 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  29.86 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  35.11 
 
 
408 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  34.62 
 
 
302 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  26.47 
 
 
781 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  32.74 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  30.57 
 
 
402 aa  94  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.54 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.28 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  28.15 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  31.53 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.73 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  29.2 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.77 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.11 
 
 
547 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.31 
 
 
311 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  30.95 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.51 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  27.65 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.35 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.69 
 
 
299 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.68 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.76 
 
 
326 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  27.66 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  29.59 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  28.47 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  27.66 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  28.7 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.31 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.04 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.42 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.37 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  29.44 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  31.07 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  30.64 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  29.71 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.13 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  30.27 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.95 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.45 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.27 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  29 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.7 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  27.46 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.7 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  29 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  29.38 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.76 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  27.05 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  31.13 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  29.55 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  29.15 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>