More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3784 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  94.91 
 
 		 451 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  95.54 
 
 		 448 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  100 
 
 		 448 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  44.01 
 
 		 306 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  42.16 
 
 		 301 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  46.13 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  41.8 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  38 
 
 		 501 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  40.07 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  38.29 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  40.07 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  38.29 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  38 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  38 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  39.74 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  41.06 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  41.06 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  44.04 
 
 		 293 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  41.41 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  36.11 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  38.75 
 
 		 498 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  41.19 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  42.72 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  42.62 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  39.53 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  38.24 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  40.89 
 
 		 323 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  37.92 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  41.44 
 
 		 374 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  39.07 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  37.58 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  39.94 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  39.2 
 
 		 292 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  39 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  48.15 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.13 
 
 		 392 aa  156  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  41.85 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  37.04 
 
 		 323 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  42.53 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  42.33 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  37.97 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  35.27 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40.85 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  36.6 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  37.08 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  39.51 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  34.86 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.95 
 
 		 339 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  36.71 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.48 
 
 		 781 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.13 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.97 
 
 		 340 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.13 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  34.11 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  31.78 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.78 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.43 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  31.61 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  33.17 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.57 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.5 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  30.18 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.21 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  36.51 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.02 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.91 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  34.04 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.67 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  35.84 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  35.64 
 
 		 336 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  31.58 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.91 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.88 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  35.64 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  32.79 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  36.53 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  34.25 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  33.15 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.73 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  32.79 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.66 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.88 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.87 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.94 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.26 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.14 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.92 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  32.2 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  29.05 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  34.36 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.2 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  32.2 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.84 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  33.01 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.46 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  31.32 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  30.73 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.6 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>