More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3861 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  100 
 
 		 300 aa  594  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  75.92 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  43.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  44.82 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  39.76 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  38.16 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  35.79 
 
 		 781 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  33.33 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  37.83 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  36.8 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  32.89 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  27.69 
 
 		 463 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  37.66 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  34.98 
 
 		 461 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  35.29 
 
 		 441 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  30.83 
 
 		 383 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  31.22 
 
 		 436 aa  85.9  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  32.3 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  29.89 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.05 
 
 		 608 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  33.04 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  30.38 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  30.38 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  36.09 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  31.53 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  31.75 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  30.92 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  32.47 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  34.88 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  29.72 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.11 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  29.9 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.47 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.9 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.93 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  30.92 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.19 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  33.8 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  31.58 
 
 		 593 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  32 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  28.69 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  29.95 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.68 
 
 		 585 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  32.85 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  31.28 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  29.29 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.81 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  28.15 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  29.5 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.37 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  29.46 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  32.61 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  32.61 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.22 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  32.61 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.96 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  30.2 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  32.9 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.48 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  30.73 
 
 		 616 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.48 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  31.22 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  30.36 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  27.82 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  30.49 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  26.87 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  30.77 
 
 		 616 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.78 
 
 		 617 aa  65.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  33.69 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.47 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  30.51 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.56 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  29.32 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  26.92 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  25 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.65 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  30.13 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.6 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  25.32 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  29.06 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  29.02 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  29.32 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.55 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.93 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.22 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  31.58 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.9 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  33.13 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  33.13 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  30.46 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  35.59 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  32.47 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  31.07 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>