More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1997 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  100 
 
 		 302 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  42.72 
 
 		 781 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  41.64 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  38.71 
 
 		 461 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  41.92 
 
 		 463 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  39.24 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  40.98 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  38.59 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  37.72 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  36.14 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  41.12 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  39.53 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.16 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  42.92 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  39.73 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  36.39 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  39.52 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  39.72 
 
 		 288 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  34.43 
 
 		 617 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  38.21 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  40.09 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  40.26 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  34.91 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.19 
 
 		 596 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.01 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.8 
 
 		 615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  40.65 
 
 		 418 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  40.19 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  32.73 
 
 		 616 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  37.22 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  43.39 
 
 		 448 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  35.41 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  33.02 
 
 		 616 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.17 
 
 		 596 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  40.43 
 
 		 416 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  39.25 
 
 		 418 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  44.81 
 
 		 448 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  38.32 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  39.27 
 
 		 392 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  39.25 
 
 		 433 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  37.43 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  30.67 
 
 		 618 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  38.5 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  37.18 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  39.43 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  43.39 
 
 		 451 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.27 
 
 		 614 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.31 
 
 		 617 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.26 
 
 		 615 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  37.09 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.26 
 
 		 615 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.26 
 
 		 615 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  36.9 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  36.9 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  36.36 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  36.36 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.88 
 
 		 614 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  29.64 
 
 		 621 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.46 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.46 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.88 
 
 		 613 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.8 
 
 		 615 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.51 
 
 		 656 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  30.59 
 
 		 618 aa  102  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.75 
 
 		 613 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  40.09 
 
 		 461 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  32.23 
 
 		 612 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.62 
 
 		 601 aa  102  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.46 
 
 		 614 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.78 
 
 		 617 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.88 
 
 		 613 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 		 616 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.11 
 
 		 617 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.08 
 
 		 620 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  34.62 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  40.17 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  33.66 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  33.49 
 
 		 616 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  30.67 
 
 		 616 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  30.67 
 
 		 616 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  34.31 
 
 		 439 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  30.67 
 
 		 616 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.6 
 
 		 597 aa  99  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.24 
 
 		 621 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.37 
 
 		 613 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  33.04 
 
 		 618 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  38.74 
 
 		 408 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0053  acid phosphatase  36.22 
 
 		 580 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  35.18 
 
 		 583 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.81 
 
 		 605 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  34.47 
 
 		 439 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  34.86 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  34.47 
 
 		 439 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  30.6 
 
 		 616 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  31.9 
 
 		 618 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  31.9 
 
 		 618 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  31.72 
 
 		 601 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>