More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2311 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69 
 
 		 615 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.39 
 
 		 614 aa  892    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  72.92 
 
 		 613 aa  944    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  81.57 
 
 		 613 aa  1038    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  63.95 
 
 		 613 aa  814    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  70.15 
 
 		 615 aa  908    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.33 
 
 		 615 aa  901    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.23 
 
 		 614 aa  895    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.23 
 
 		 614 aa  894    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  65.15 
 
 		 614 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69 
 
 		 615 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  100 
 
 		 612 aa  1246    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.33 
 
 		 615 aa  903    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.23 
 
 		 614 aa  896    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  73.08 
 
 		 613 aa  943    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  59.64 
 
 		 617 aa  765    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.84 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.26 
 
 		 620 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.77 
 
 		 621 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  45.42 
 
 		 617 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  46.07 
 
 		 616 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  45.45 
 
 		 616 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  44.25 
 
 		 616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.6 
 
 		 617 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  42.38 
 
 		 616 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  42.48 
 
 		 618 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.93 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  42.79 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  41.99 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  42.16 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  42.16 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  42.93 
 
 		 622 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  41.99 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  42.93 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  42.93 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  42.93 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  42.93 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  41.72 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  42.93 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  45.1 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  42.76 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.61 
 
 		 616 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  42.93 
 
 		 618 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.61 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  44.17 
 
 		 616 aa  435  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  43.82 
 
 		 616 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  43.77 
 
 		 616 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  42.86 
 
 		 610 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.35 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.81 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  44 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.26 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.21 
 
 		 611 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  40.75 
 
 		 618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  39.18 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.08 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.35 
 
 		 626 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.5 
 
 		 661 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.99 
 
 		 625 aa  326  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.87 
 
 		 608 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.31 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.15 
 
 		 590 aa  300  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.38 
 
 		 585 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  33.72 
 
 		 611 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.03 
 
 		 595 aa  290  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  36.87 
 
 		 609 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.61 
 
 		 609 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.08 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.08 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.51 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.51 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.07 
 
 		 589 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.45 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  34.95 
 
 		 583 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.47 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.71 
 
 		 590 aa  257  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.35 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.42 
 
 		 604 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 		 649 aa  220  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 		 595 aa  219  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.67 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  31.13 
 
 		 623 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.54 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.54 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.64 
 
 		 570 aa  204  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.42 
 
 		 593 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.64 
 
 		 656 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  30.91 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.79 
 
 		 831 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.65 
 
 		 597 aa  193  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.13 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.62 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.65 
 
 		 595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  28.65 
 
 		 569 aa  191  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.48 
 
 		 562 aa  190  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.94 
 
 		 834 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.65 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.13 
 
 		 583 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.07 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>