More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3360 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  95.13 
 
 		 448 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  95.58 
 
 		 448 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  100 
 
 		 451 aa  859    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  44.08 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  42.53 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  46.46 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  42.62 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  39.14 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  39.45 
 
 		 501 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  38.91 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  38.91 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  39.45 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  37.03 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  37.03 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  39.74 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  39.74 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  39.4 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  43.71 
 
 		 293 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  42.21 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  35.76 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  43.04 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  41.55 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  38.41 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  42.28 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  36.84 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  37.82 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  37.91 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  42.3 
 
 		 374 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  34.15 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  40.26 
 
 		 323 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  40.2 
 
 		 292 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  33.88 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  38.74 
 
 		 288 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  38.87 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  41.13 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  47.33 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  36.93 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  37.54 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  42.52 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  36.42 
 
 		 323 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  35.27 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  37.12 
 
 		 316 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  40 
 
 		 302 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  36.52 
 
 		 408 aa  113  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  37.08 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  38.6 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  32.91 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  35.19 
 
 		 321 aa  97.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.95 
 
 		 339 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.49 
 
 		 781 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  33.96 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  33.94 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  32.17 
 
 		 315 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.12 
 
 		 371 aa  90.5  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.17 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.91 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  33.17 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  31.61 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  36.51 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.59 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.53 
 
 		 290 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  32.21 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  36.99 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  35.15 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  35.64 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  34.04 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  31.73 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  30 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  33.82 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  32.79 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.09 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  33.15 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  31.73 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.45 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.3 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  32.79 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.87 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.71 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.44 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  33.49 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.52 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  28.91 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  33.79 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.6 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.65 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.44 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.46 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  32.2 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  32.2 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.79 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.26 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  31.32 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.62 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.2 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.97 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.32 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>