More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0057 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  100 
 
 		 321 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1752  peptidase S49  44.2 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1623  serine peptidase  45.12 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0324508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  40.69 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  42.67 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  34.91 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  33.85 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  35.85 
 
 		 441 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  33.44 
 
 		 416 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  35 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  34.4 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  32.63 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  34.88 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  32.05 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  33.8 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3650  periplasmic serine protease (ClpP class)  34.91 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  31.27 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  31.27 
 
 		 418 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  33.79 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  30.89 
 
 		 433 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  28.37 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  34.7 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1647  peptidase  34.13 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  33.79 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  31.31 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  31.4 
 
 		 436 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  33.78 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  30.89 
 
 		 433 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  32.04 
 
 		 501 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  33.17 
 
 		 353 aa  95.9  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  31.3 
 
 		 498 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  34.68 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  34.16 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  33.97 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  31.75 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  31.75 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  31.01 
 
 		 501 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  31.34 
 
 		 501 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  31.35 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  30.95 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  29.6 
 
 		 781 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  31.35 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  30.99 
 
 		 501 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  30.99 
 
 		 501 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  32.88 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  32.09 
 
 		 450 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  29.91 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  36.87 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  36.31 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  33.86 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  30.29 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  36.31 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.68 
 
 		 656 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1336  peptidase S49  31.53 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  31.1 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  31.55 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  29.95 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.19 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.56 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  28.74 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.86 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  28.74 
 
 		 609 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.09 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  28.57 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.34 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.91 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  29.06 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2635  peptidase S49  30.73 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.194824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.29 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  28.65 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  28.65 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  30.73 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  30.73 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.82 
 
 		 596 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.48 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.54 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.77 
 
 		 601 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.64 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  30.95 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.54 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  30.22 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  28.35 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.96 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  29.36 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.03 
 
 		 616 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  25 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  31.67 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.09 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.74 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.89 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  27.7 
 
 		 618 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.34 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  31.28 
 
 		 616 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.55 
 
 		 583 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.57 
 
 		 617 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  29.39 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  27.91 
 
 		 612 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>