More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1885 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  58.02 
 
 		 293 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  53.24 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  55.26 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  42.96 
 
 		 441 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  46.62 
 
 		 383 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  37.5 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  38.38 
 
 		 436 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  43.64 
 
 		 408 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  36.3 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  36.3 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  42.61 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  36.99 
 
 		 463 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  35.64 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  35.64 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  34.15 
 
 		 450 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  35.56 
 
 		 501 aa  175  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  35.56 
 
 		 501 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  35.56 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  34.86 
 
 		 501 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  34.86 
 
 		 501 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  35.62 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  38.46 
 
 		 445 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  34.78 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  36.63 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  44.68 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  35.85 
 
 		 498 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  35.74 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  35.07 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  42.16 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  36.26 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  43.19 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  35.38 
 
 		 433 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  41.67 
 
 		 418 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  35.56 
 
 		 461 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  42.16 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  34.59 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  40.7 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  40.7 
 
 		 448 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  40.7 
 
 		 448 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  41.12 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  32.88 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  37.26 
 
 		 402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  37.56 
 
 		 461 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  31.56 
 
 		 481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  31.98 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  33.45 
 
 		 781 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  34.7 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.26 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  35.16 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.38 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  30.09 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.4 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  32 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.8 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.52 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.44 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.63 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.44 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  30.14 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.67 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.83 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.4 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.79 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.1 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  28.57 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  30.11 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  28.15 
 
 		 601 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.38 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.78 
 
 		 875 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  27.75 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.09 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  28.5 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.94 
 
 		 596 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  28.09 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.97 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.35 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.5 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.59 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  28.09 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  29.31 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  23.65 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.57 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 		 597 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.92 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.14 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  31.32 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.63 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.77 
 
 		 656 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  28.11 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.8 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.8 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.74 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.57 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23000  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.09 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.202582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.48 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.73 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.43 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>