More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2812 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2812  gifsy-1 prophage head-tail preconnector gp5  100 
 
 		 498 aa  1016    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.779132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1457  head-tail preconnector protein GP5  63.87 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0894  head-tail preconnector protein GP5  63.27 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1289  head-tail preconnector protein GP5  63.47 
 
 		 501 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2774  head-tail preconnector protein GP5  63.67 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.821156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1189  head-tail preconnector protein GP5  63.67 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10039  capsid component  51.34 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00734  hypothetical protein  51.34 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2094  peptidase S49  51.34 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00430491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1786  minor capsid protein C  51.34 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1623  minor capsid protein C  51.34 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0216288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2225  S49 family peptidase  50.13 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0230467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01981  hypothetical protein  40.87 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3063  serine peptidase  38.16 
 
 		 293 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011289  hitchhiker  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2816  serine peptidase  35.71 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2745  serine peptidase  35.81 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2091  S49 family peptidase  36.86 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2046  serine peptidase  35.37 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1326  serine peptidase  35.81 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0433516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3206  peptidase S49  33.67 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  38.82 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1657  peptidase S49  34.03 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.954617  normal  0.14225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2661  prophage LambdaMc01, U7 family peptidase  41.55 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2894  serine peptidase  35.36 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0858  bacteriophage-like protein  33.79 
 
 		 416 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0571682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1819  periplasmic serine proteases  36.55 
 
 		 383 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2574  serine peptidase  39.19 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3878  phage minor capsid protein C, putative  38.25 
 
 		 323 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1261  serine peptidase  39.19 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1885  peptidase S49  35.06 
 
 		 292 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0104  peptidase S49  36.56 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3627  serine peptidase  37.59 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.490835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3784  serine peptidase  37.96 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0602  prophage LambdaW4, minor capsid protein C, putative  32.04 
 
 		 353 aa  152  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3360  peptidase S49  37.59 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.545404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1546  peptidase S49  39.81 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4143  peptidase S49  34.43 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2460  peptidase S49  32.64 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0595  peptidase S49  36.9 
 
 		 420 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2314  Periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.37 
 
 		 306 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3650  serine peptidase  41.82 
 
 		 323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0680  peptidase S49  32.55 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.415675  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6530  peptidase S49  31.06 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7143  peptidase S49  31.25 
 
 		 311 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1997  peptidase S49  37.22 
 
 		 302 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00735  hypothetical protein  41.48 
 
 		 201 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1063  peptidase S49  34.26 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.784221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1004  serine peptidase  31.11 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  29.12 
 
 		 781 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0057  peptidase S49  31.3 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.44 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.6 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.77 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.92 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.09 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.65 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  32.09 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  29.73 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  30.48 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.57 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.05 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  25.77 
 
 		 313 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  28.87 
 
 		 316 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.29 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  29.83 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0282  peptidase S49  33.81 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.348409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.79 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  29.61 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  31.18 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.96 
 
 		 287 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.55 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  25 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  31.11 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  30.65 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  29.14 
 
 		 340 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  32.11 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  31.18 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  28.49 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.29 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  29.05 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  26.88 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  25.88 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.35 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.44 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3861  peptidase S49  31.61 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.57 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  25.88 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.3 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  27.78 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  24.9 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.34 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.95 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  28.33 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  24.9 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2584  peptidase S49  31.46 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000432276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  30.56 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  28.33 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  28.57 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  25.34 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>