More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0907 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.84 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.94 
 
 
348 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.45 
 
 
282 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  42.01 
 
 
410 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.3 
 
 
342 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  38.58 
 
 
394 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.82 
 
 
274 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.12 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.64 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.8 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.32 
 
 
299 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.02 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  37.55 
 
 
316 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.5 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.55 
 
 
382 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.55 
 
 
382 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.45 
 
 
587 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.68 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.7 
 
 
339 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.54 
 
 
290 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.74 
 
 
656 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.73 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.23 
 
 
605 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.04 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.29 
 
 
598 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  37.88 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.29 
 
 
598 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.44 
 
 
608 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  36.79 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.98 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.31 
 
 
298 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.92 
 
 
611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.55 
 
 
336 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  37.33 
 
 
612 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 
335 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.93 
 
 
831 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  38.64 
 
 
340 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.52 
 
 
637 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  35.91 
 
 
280 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.56 
 
 
303 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.27 
 
 
296 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.77 
 
 
293 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 
615 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.03 
 
 
649 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 
615 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 
615 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.75 
 
 
324 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 
615 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  33.78 
 
 
621 aa  122  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.17 
 
 
327 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.57 
 
 
613 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.04 
 
 
613 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.74 
 
 
617 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.2 
 
 
307 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.72 
 
 
614 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.68 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.22 
 
 
614 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.22 
 
 
614 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.22 
 
 
614 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  36.13 
 
 
583 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  36.29 
 
 
609 aa  115  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  32.93 
 
 
320 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.12 
 
 
616 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.09 
 
 
563 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.57 
 
 
595 aa  115  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  37.06 
 
 
616 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.4 
 
 
613 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.72 
 
 
615 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.41 
 
 
613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.47 
 
 
590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  36.14 
 
 
616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  35.29 
 
 
623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  34.96 
 
 
618 aa  114  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.63 
 
 
617 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  37.76 
 
 
616 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  32.8 
 
 
272 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.38 
 
 
329 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.2 
 
 
611 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.71 
 
 
319 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.8 
 
 
270 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  35.8 
 
 
270 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.44 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.49 
 
 
605 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  38.19 
 
 
622 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.49 
 
 
605 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.44 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  32.11 
 
 
610 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  35.15 
 
 
618 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.64 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  38.19 
 
 
618 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>