More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0639 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 
595 aa  1212    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.14 
 
 
590 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.92 
 
 
587 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.05 
 
 
585 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.82 
 
 
608 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.1 
 
 
589 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.29 
 
 
605 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  35.86 
 
 
611 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.32 
 
 
590 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  37.96 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.77 
 
 
598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.77 
 
 
598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  36.07 
 
 
513 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  38.55 
 
 
616 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.34 
 
 
615 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  38.36 
 
 
616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  35.46 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  37.3 
 
 
612 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  40.96 
 
 
621 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.46 
 
 
617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.74 
 
 
614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  37.78 
 
 
618 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  37.78 
 
 
618 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.78 
 
 
618 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  37.78 
 
 
622 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.5 
 
 
616 aa  303  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  37.78 
 
 
618 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.12 
 
 
615 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.31 
 
 
615 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  37.78 
 
 
618 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.31 
 
 
615 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  37.78 
 
 
618 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.24 
 
 
618 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.39 
 
 
614 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.39 
 
 
614 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.93 
 
 
615 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  40 
 
 
618 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.59 
 
 
613 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  40 
 
 
618 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  40 
 
 
618 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  38.63 
 
 
618 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.45 
 
 
613 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  39.8 
 
 
618 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  37.7 
 
 
616 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  37.61 
 
 
618 aa  298  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.77 
 
 
604 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.51 
 
 
613 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  39.8 
 
 
618 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.22 
 
 
617 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  37.25 
 
 
616 aa  294  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.5 
 
 
614 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  41.45 
 
 
616 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  41.01 
 
 
616 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  41.45 
 
 
616 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.91 
 
 
617 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.54 
 
 
614 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  37.52 
 
 
616 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.58 
 
 
613 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  36.96 
 
 
617 aa  289  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.88 
 
 
633 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  38.42 
 
 
633 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  37.78 
 
 
618 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.58 
 
 
640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  35.32 
 
 
618 aa  280  4e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.83 
 
 
637 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.17 
 
 
620 aa  277  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.3 
 
 
613 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.58 
 
 
629 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  35.57 
 
 
610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.79 
 
 
611 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  34.83 
 
 
623 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.46 
 
 
621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.73 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.8 
 
 
563 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.02 
 
 
566 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 
605 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 
605 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.16 
 
 
831 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 
569 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.7 
 
 
661 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.05 
 
 
595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.84 
 
 
562 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  31.38 
 
 
609 aa  238  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.5 
 
 
626 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.01 
 
 
571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.83 
 
 
595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.38 
 
 
561 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.72 
 
 
561 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  34.22 
 
 
593 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.07 
 
 
593 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.07 
 
 
593 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.84 
 
 
649 aa  230  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.15 
 
 
547 aa  229  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.27 
 
 
593 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.97 
 
 
594 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.59 
 
 
596 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  31.76 
 
 
834 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.33 
 
 
625 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.81 
 
 
570 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>