More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0560 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  62.75 
 
 		 596 aa  751    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 596 aa  1210    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.24 
 
 		 597 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.19 
 
 		 597 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  49.62 
 
 		 583 aa  503  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  48.71 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  46.41 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.94 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.92 
 
 		 585 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.49 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.49 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.67 
 
 		 834 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.62 
 
 		 608 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.33 
 
 		 590 aa  230  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  35.22 
 
 		 834 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.93 
 
 		 834 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  32.47 
 
 		 609 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.81 
 
 		 831 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.94 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.92 
 
 		 605 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  29.94 
 
 		 611 aa  217  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.53 
 
 		 604 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.59 
 
 		 595 aa  210  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.58 
 
 		 587 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  30.39 
 
 		 513 aa  210  7e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  31.02 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.06 
 
 		 563 aa  208  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.14 
 
 		 617 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  30.37 
 
 		 593 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.57 
 
 		 589 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  32.51 
 
 		 617 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.68 
 
 		 640 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  31.71 
 
 		 569 aa  196  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.62 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.83 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.42 
 
 		 615 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  31.44 
 
 		 610 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.31 
 
 		 623 aa  193  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.97 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.62 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.97 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.04 
 
 		 629 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.85 
 
 		 616 aa  191  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 		 613 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.73 
 
 		 613 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.55 
 
 		 615 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  30.39 
 
 		 633 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.26 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 614 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.61 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 615 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  31.95 
 
 		 616 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.04 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  32.07 
 
 		 612 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.8 
 
 		 562 aa  187  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.39 
 
 		 633 aa  187  7e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.62 
 
 		 588 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.98 
 
 		 637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.16 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.49 
 
 		 620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  30.75 
 
 		 616 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.94 
 
 		 613 aa  183  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  32.1 
 
 		 555 aa  183  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.04 
 
 		 617 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.46 
 
 		 617 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  31.09 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.74 
 
 		 570 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  28.57 
 
 		 621 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  30.07 
 
 		 618 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.05 
 
 		 613 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  30.07 
 
 		 618 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.07 
 
 		 618 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  29.9 
 
 		 622 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  29.9 
 
 		 618 aa  176  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  28.8 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  29.9 
 
 		 618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  29.06 
 
 		 616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.17 
 
 		 661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  29.9 
 
 		 618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.06 
 
 		 614 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  30.67 
 
 		 618 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.68 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  25.93 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  29.72 
 
 		 618 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  30.54 
 
 		 618 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.32 
 
 		 561 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.14 
 
 		 593 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.14 
 
 		 593 aa  170  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.57 
 
 		 595 aa  170  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  31.69 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.04 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.14 
 
 		 593 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  31.82 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  31.82 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  31.63 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  31.06 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.94 
 
 		 594 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.86 
 
 		 875 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.84 
 
 		 626 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>