More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2221 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 661 aa  1313    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  53.93 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  51.11 
 
 		 625 aa  554  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  36.85 
 
 		 616 aa  363  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  39.08 
 
 		 622 aa  359  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  39.08 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.08 
 
 		 618 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  39.08 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  39.08 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  39.08 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  39.08 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  37.03 
 
 		 616 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  37.77 
 
 		 618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.3 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  38.91 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  37.85 
 
 		 618 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  37.85 
 
 		 618 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  37.85 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  37.85 
 
 		 618 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  37.85 
 
 		 618 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.16 
 
 		 616 aa  349  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  39.03 
 
 		 618 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  36.85 
 
 		 612 aa  346  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.16 
 
 		 613 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  38.91 
 
 		 618 aa  343  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.42 
 
 		 613 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.92 
 
 		 640 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.17 
 
 		 621 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  35.49 
 
 		 616 aa  337  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.34 
 
 		 613 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  34.58 
 
 		 616 aa  336  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.2 
 
 		 615 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39 
 
 		 617 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  37.94 
 
 		 633 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  37.96 
 
 		 616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.74 
 
 		 633 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.14 
 
 		 637 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.16 
 
 		 615 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  37.55 
 
 		 616 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  33.82 
 
 		 617 aa  323  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.98 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  34.89 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.98 
 
 		 615 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.59 
 
 		 617 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  37.36 
 
 		 616 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  37.36 
 
 		 616 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.8 
 
 		 615 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.23 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.05 
 
 		 614 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  33.6 
 
 		 621 aa  316  7e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.38 
 
 		 614 aa  316  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.87 
 
 		 614 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.33 
 
 		 620 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.46 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.28 
 
 		 613 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.49 
 
 		 605 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  32.56 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.49 
 
 		 605 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.85 
 
 		 611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.04 
 
 		 613 aa  280  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.54 
 
 		 617 aa  278  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.18 
 
 		 605 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.12 
 
 		 609 aa  253  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  34.46 
 
 		 609 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.02 
 
 		 611 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.7 
 
 		 595 aa  242  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.38 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.65 
 
 		 608 aa  240  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.19 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.19 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.98 
 
 		 590 aa  233  7.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.92 
 
 		 589 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 585 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.05 
 
 		 656 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.2 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.51 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  32.35 
 
 		 513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.08 
 
 		 595 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  31.15 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.89 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.2 
 
 		 595 aa  201  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.71 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.94 
 
 		 597 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.65 
 
 		 597 aa  193  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.57 
 
 		 593 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.57 
 
 		 593 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.82 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.33 
 
 		 593 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  31.59 
 
 		 601 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.06 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.42 
 
 		 547 aa  184  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.65 
 
 		 596 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  33.97 
 
 		 623 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.43 
 
 		 595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.4 
 
 		 594 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  30.82 
 
 		 583 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.06 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  27.31 
 
 		 552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  26.9 
 
 		 566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>