More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1968 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  66.5 
 
 		 618 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.34 
 
 		 618 aa  857    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  70.02 
 
 		 616 aa  860    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  74.07 
 
 		 616 aa  979    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  70.34 
 
 		 616 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  66.99 
 
 		 618 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  66.83 
 
 		 618 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  66.83 
 
 		 618 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  66.5 
 
 		 618 aa  858    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  66.67 
 
 		 618 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  66.99 
 
 		 618 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  66.67 
 
 		 618 aa  861    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  79.74 
 
 		 616 aa  1061    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  56.63 
 
 		 618 aa  726    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  74.39 
 
 		 616 aa  982    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  70.02 
 
 		 616 aa  862    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  66.67 
 
 		 618 aa  859    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  65.7 
 
 		 618 aa  858    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 617 aa  1261    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  66.67 
 
 		 618 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  66.83 
 
 		 618 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  66.67 
 
 		 618 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  72.01 
 
 		 618 aa  912    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  66.83 
 
 		 622 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  48.21 
 
 		 616 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  45.71 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  45.38 
 
 		 617 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  46.03 
 
 		 616 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.51 
 
 		 614 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.57 
 
 		 615 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.48 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.02 
 
 		 614 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.51 
 
 		 614 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.32 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.15 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.86 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.05 
 
 		 637 aa  475  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.84 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.54 
 
 		 617 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  42.72 
 
 		 612 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  40.41 
 
 		 621 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.69 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.67 
 
 		 614 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.56 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.69 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.24 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.6 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.21 
 
 		 613 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.03 
 
 		 617 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.4 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.8 
 
 		 629 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  39.86 
 
 		 633 aa  362  8e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.45 
 
 		 613 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.68 
 
 		 633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.3 
 
 		 640 aa  356  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  36.62 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.38 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39 
 
 		 661 aa  325  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.14 
 
 		 625 aa  324  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  34.84 
 
 		 608 aa  316  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  35.39 
 
 		 611 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  35.85 
 
 		 609 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.98 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.38 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.93 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.93 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.86 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.82 
 
 		 589 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  36.73 
 
 		 583 aa  273  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.72 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.72 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.8 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.89 
 
 		 585 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.35 
 
 		 590 aa  256  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.35 
 
 		 513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.4 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  31.54 
 
 		 609 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.63 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.39 
 
 		 595 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.02 
 
 		 593 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.02 
 
 		 593 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.05 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  33.47 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  32.77 
 
 		 623 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.4 
 
 		 593 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.48 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  27.55 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 		 563 aa  200  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.15 
 
 		 594 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.19 
 
 		 595 aa  194  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.83 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  26.78 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.89 
 
 		 656 aa  181  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.93 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.08 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.56 
 
 		 584 aa  179  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.72 
 
 		 570 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.04 
 
 		 831 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  29.79 
 
 		 834 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  28.93 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>