More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1402 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 649 aa  1305    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.9 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  35.15 
 
 		 569 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.54 
 
 		 561 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.48 
 
 		 563 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.42 
 
 		 589 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 		 595 aa  268  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  37 
 
 		 583 aa  266  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.39 
 
 		 585 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.79 
 
 		 831 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  34.15 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.54 
 
 		 834 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  35.54 
 
 		 834 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.87 
 
 		 597 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.76 
 
 		 834 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.3 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  34.1 
 
 		 601 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.28 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.62 
 
 		 605 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.67 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.67 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.94 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33 
 
 		 562 aa  248  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.97 
 
 		 590 aa  247  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34 
 
 		 590 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.48 
 
 		 656 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.19 
 
 		 597 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  34.22 
 
 		 593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  32.82 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  31.72 
 
 		 616 aa  240  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.42 
 
 		 601 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  30.78 
 
 		 611 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  33.74 
 
 		 583 aa  238  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  32.64 
 
 		 555 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.09 
 
 		 604 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  31.32 
 
 		 616 aa  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.01 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  31.21 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.71 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  31.4 
 
 		 617 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.81 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.58 
 
 		 637 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  33.62 
 
 		 612 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.91 
 
 		 596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 		 875 aa  218  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.67 
 
 		 623 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.12 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.07 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34 
 
 		 613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.84 
 
 		 595 aa  215  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.19 
 
 		 613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 		 614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.25 
 
 		 617 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.39 
 
 		 614 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.73 
 
 		 615 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.37 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.55 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.41 
 
 		 613 aa  211  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.12 
 
 		 640 aa  210  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.89 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.8 
 
 		 613 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.22 
 
 		 614 aa  207  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30 
 
 		 615 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.17 
 
 		 633 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  30.17 
 
 		 633 aa  205  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.21 
 
 		 561 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  28.46 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.12 
 
 		 593 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.12 
 
 		 593 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.68 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.68 
 
 		 594 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32 
 
 		 617 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.25 
 
 		 614 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  30.28 
 
 		 610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.89 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.12 
 
 		 593 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.21 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  30.02 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 621 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.11 
 
 		 595 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  28.85 
 
 		 618 aa  193  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  29.45 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  29.45 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  29.45 
 
 		 618 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  29.45 
 
 		 622 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.27 
 
 		 616 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.45 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  28.08 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  29.45 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  29.45 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  29.24 
 
 		 618 aa  187  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  28.05 
 
 		 616 aa  185  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  29.4 
 
 		 618 aa  185  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  27.67 
 
 		 616 aa  185  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  28.91 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.5 
 
 		 611 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  28.65 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.04 
 
 		 661 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>