More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1941 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.34 
 
 		 615 aa  856    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.34 
 
 		 615 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.12 
 
 		 614 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.5 
 
 		 615 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  69.98 
 
 		 613 aa  915    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  70.64 
 
 		 613 aa  905    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 613 aa  1251    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  62.81 
 
 		 613 aa  803    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  64.98 
 
 		 615 aa  837    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.34 
 
 		 615 aa  860    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  73.08 
 
 		 612 aa  943    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  65.79 
 
 		 614 aa  848    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  65.79 
 
 		 614 aa  849    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  61.89 
 
 		 614 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  65.79 
 
 		 614 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  57.4 
 
 		 617 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  50.47 
 
 		 637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  45.47 
 
 		 617 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.76 
 
 		 620 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.45 
 
 		 621 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  45.35 
 
 		 616 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  45.17 
 
 		 616 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  43.72 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.21 
 
 		 617 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  42.16 
 
 		 616 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  42.62 
 
 		 618 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.66 
 
 		 616 aa  465  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  41.41 
 
 		 616 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  41.64 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  42.13 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  41.8 
 
 		 622 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  42.3 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  41.64 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  42.3 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  42.13 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  41.64 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  41.64 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.64 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  41.64 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.55 
 
 		 618 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  41.48 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  41.68 
 
 		 618 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  41.64 
 
 		 618 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  42.75 
 
 		 610 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.43 
 
 		 617 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.3 
 
 		 611 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  41.73 
 
 		 616 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  41.9 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  41.94 
 
 		 616 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  39.51 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.51 
 
 		 629 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.89 
 
 		 640 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  41.68 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  37.6 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.51 
 
 		 633 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.21 
 
 		 613 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.32 
 
 		 626 aa  349  8e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.16 
 
 		 625 aa  323  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.51 
 
 		 661 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.05 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  36.08 
 
 		 609 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.95 
 
 		 605 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.55 
 
 		 590 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.18 
 
 		 611 aa  292  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  34.29 
 
 		 609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.35 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.06 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 		 585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.06 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.6 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.6 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.94 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.89 
 
 		 595 aa  273  8.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.39 
 
 		 656 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.45 
 
 		 587 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  34.49 
 
 		 583 aa  263  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.85 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.38 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.45 
 
 		 590 aa  250  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.56 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.77 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.71 
 
 		 649 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.87 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  31.74 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.08 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.08 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  32.08 
 
 		 623 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.13 
 
 		 595 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.08 
 
 		 593 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.58 
 
 		 570 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  30.21 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  32.4 
 
 		 601 aa  203  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  29.98 
 
 		 583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.26 
 
 		 584 aa  197  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.07 
 
 		 594 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.7 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.87 
 
 		 562 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.6 
 
 		 597 aa  193  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.23 
 
 		 595 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.82 
 
 		 831 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>