More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2585 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 637 aa  1303    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  51.44 
 
 		 621 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.45 
 
 		 620 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  50.47 
 
 		 613 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.68 
 
 		 613 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.88 
 
 		 613 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.98 
 
 		 615 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.91 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.75 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.19 
 
 		 615 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.22 
 
 		 614 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.19 
 
 		 615 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.19 
 
 		 615 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.75 
 
 		 614 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.19 
 
 		 615 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  49.84 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.23 
 
 		 617 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  45.86 
 
 		 616 aa  572  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  45.7 
 
 		 616 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  45.66 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.01 
 
 		 613 aa  548  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.93 
 
 		 614 aa  548  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  44.87 
 
 		 616 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.99 
 
 		 616 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.88 
 
 		 617 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  41.01 
 
 		 616 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  42.31 
 
 		 618 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  40.38 
 
 		 616 aa  469  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  42.54 
 
 		 616 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  42.54 
 
 		 616 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.48 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  40.6 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  40.16 
 
 		 618 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  40.16 
 
 		 618 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  42.38 
 
 		 616 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.46 
 
 		 617 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  40.16 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.16 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  40.16 
 
 		 618 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  40.28 
 
 		 618 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  40.16 
 
 		 622 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  40.13 
 
 		 618 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  40.28 
 
 		 618 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  40.16 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  40.44 
 
 		 618 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  40 
 
 		 618 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  40.16 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.63 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  39.49 
 
 		 618 aa  436  1e-121  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.78 
 
 		 629 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  41.86 
 
 		 633 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.63 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.36 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  38.92 
 
 		 610 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.58 
 
 		 611 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  38.23 
 
 		 621 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.56 
 
 		 626 aa  318  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.7 
 
 		 605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  35.24 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  34.43 
 
 		 608 aa  310  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.08 
 
 		 625 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.85 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  33.61 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.5 
 
 		 661 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.39 
 
 		 589 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.81 
 
 		 656 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.43 
 
 		 585 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.74 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.74 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.02 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.86 
 
 		 598 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.86 
 
 		 598 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 		 590 aa  270  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  33.09 
 
 		 583 aa  270  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.7 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  35.53 
 
 		 513 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.71 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  32.55 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.19 
 
 		 604 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.6 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  34.5 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.36 
 
 		 595 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.58 
 
 		 649 aa  224  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.74 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.74 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  32.29 
 
 		 569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.62 
 
 		 563 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.31 
 
 		 593 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.79 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.6 
 
 		 595 aa  203  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.18 
 
 		 570 aa  200  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.46 
 
 		 594 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.36 
 
 		 601 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  28.57 
 
 		 601 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.8 
 
 		 597 aa  187  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.55 
 
 		 584 aa  187  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.32 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.25 
 
 		 561 aa  183  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.47 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.09 
 
 		 597 aa  183  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>