More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0306 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  100 
 
 		 609 aa  1231    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  35.75 
 
 		 621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.02 
 
 		 614 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.86 
 
 		 614 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.06 
 
 		 617 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.28 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.49 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.12 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.12 
 
 		 615 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.44 
 
 		 613 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.86 
 
 		 614 aa  300  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.28 
 
 		 613 aa  297  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  34.69 
 
 		 612 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.11 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.34 
 
 		 614 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.67 
 
 		 615 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.16 
 
 		 613 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  34.92 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  32.47 
 
 		 616 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.98 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  34.93 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  33.51 
 
 		 618 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  33.51 
 
 		 618 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  33.33 
 
 		 622 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  33.33 
 
 		 618 aa  273  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  31.74 
 
 		 616 aa  273  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.51 
 
 		 618 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  31.81 
 
 		 616 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  34.56 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  34.56 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  34.56 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  31.57 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  33.33 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  34.74 
 
 		 618 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  33.16 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  34.22 
 
 		 610 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  30.55 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  32.06 
 
 		 616 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.55 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.55 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.59 
 
 		 637 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.82 
 
 		 617 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.79 
 
 		 616 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 		 626 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  33.4 
 
 		 618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  33.96 
 
 		 618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.92 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.92 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.82 
 
 		 629 aa  256  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  31.34 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  34.71 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.95 
 
 		 605 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  32.85 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  34.19 
 
 		 616 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  34.13 
 
 		 616 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.56 
 
 		 620 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  34.13 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.73 
 
 		 621 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.15 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.52 
 
 		 633 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.12 
 
 		 661 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.62 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  33.33 
 
 		 633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.54 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.62 
 
 		 625 aa  236  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.75 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.92 
 
 		 590 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.2 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.19 
 
 		 590 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.73 
 
 		 595 aa  227  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.54 
 
 		 604 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.49 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  32.95 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  31.68 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.97 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.96 
 
 		 595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.22 
 
 		 595 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.95 
 
 		 563 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.45 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.57 
 
 		 547 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.74 
 
 		 834 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  31.83 
 
 		 834 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  28.63 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.54 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.89 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.5 
 
 		 831 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  27.77 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  29.04 
 
 		 623 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.49 
 
 		 649 aa  177  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.96 
 
 		 834 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.71 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  29.25 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.58 
 
 		 566 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.66 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.89 
 
 		 596 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.96 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  27.27 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.3 
 
 		 593 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>