More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1579 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  73.54 
 
 		 616 aa  971    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  61.46 
 
 		 617 aa  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  74.03 
 
 		 616 aa  964    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  100 
 
 		 616 aa  1256    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.48 
 
 		 616 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  48.14 
 
 		 618 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  46.7 
 
 		 616 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.21 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  47.5 
 
 		 622 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  46.54 
 
 		 616 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  47.5 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.5 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.87 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  47.5 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  47.33 
 
 		 618 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  47.17 
 
 		 618 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  47.33 
 
 		 618 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.62 
 
 		 614 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  47.33 
 
 		 618 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  46.84 
 
 		 618 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.63 
 
 		 615 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.62 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.46 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  47.5 
 
 		 618 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.71 
 
 		 615 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.82 
 
 		 614 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.63 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.47 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.31 
 
 		 615 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  47.68 
 
 		 616 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  44.25 
 
 		 612 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  47.52 
 
 		 616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  46.08 
 
 		 620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  47.51 
 
 		 616 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.72 
 
 		 613 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.25 
 
 		 613 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.61 
 
 		 613 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.49 
 
 		 617 aa  505  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.21 
 
 		 621 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.02 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  41.77 
 
 		 618 aa  482  1e-135  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.16 
 
 		 617 aa  482  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.51 
 
 		 613 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  41.57 
 
 		 621 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.56 
 
 		 613 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  39.17 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.13 
 
 		 611 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.54 
 
 		 629 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.95 
 
 		 640 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  39.54 
 
 		 633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.16 
 
 		 633 aa  356  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.43 
 
 		 626 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.97 
 
 		 625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.25 
 
 		 661 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.57 
 
 		 590 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  34.66 
 
 		 608 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.06 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.06 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.18 
 
 		 585 aa  283  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  35.17 
 
 		 609 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.79 
 
 		 589 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  33.28 
 
 		 611 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.98 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.24 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  37.93 
 
 		 583 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.64 
 
 		 590 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.14 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.68 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.68 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  33.04 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.22 
 
 		 656 aa  259  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.22 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  37 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.21 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.02 
 
 		 604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.52 
 
 		 595 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 649 aa  232  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  32.44 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.2 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.4 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.55 
 
 		 584 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  32.61 
 
 		 623 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  29.23 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  30.77 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.72 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.14 
 
 		 594 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.4 
 
 		 593 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.4 
 
 		 593 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.69 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.32 
 
 		 595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.67 
 
 		 595 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.61 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.9 
 
 		 547 aa  187  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.35 
 
 		 831 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.92 
 
 		 597 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>