More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1901 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.59 
 
 		 614 aa  860    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  63.62 
 
 		 613 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.43 
 
 		 615 aa  870    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  62.81 
 
 		 613 aa  815    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.83 
 
 		 615 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.67 
 
 		 615 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 613 aa  1255    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  63.95 
 
 		 612 aa  827    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.67 
 
 		 615 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  66.67 
 
 		 615 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.59 
 
 		 614 aa  863    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.43 
 
 		 614 aa  860    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  63.95 
 
 		 613 aa  838    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  70.68 
 
 		 614 aa  898    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  67.27 
 
 		 614 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  61.69 
 
 		 617 aa  786    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.07 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  45.15 
 
 		 617 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.87 
 
 		 621 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  43.44 
 
 		 616 aa  505  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  43.9 
 
 		 616 aa  505  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  42.51 
 
 		 616 aa  482  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  43.39 
 
 		 618 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  43.39 
 
 		 618 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  43.39 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  43.55 
 
 		 618 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  43.55 
 
 		 618 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.65 
 
 		 616 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.48 
 
 		 617 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  42.97 
 
 		 618 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  42.28 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.28 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  42.28 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  41.34 
 
 		 616 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  42.28 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  42.28 
 
 		 622 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  42.28 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  42.28 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  42.11 
 
 		 618 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  40.85 
 
 		 616 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  43.23 
 
 		 618 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  42.28 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  42.67 
 
 		 616 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  42.83 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  42.88 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.84 
 
 		 617 aa  422  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.04 
 
 		 611 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.34 
 
 		 640 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  39.87 
 
 		 621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.35 
 
 		 629 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  41.16 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  37.7 
 
 		 618 aa  394  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.87 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  40.66 
 
 		 633 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.65 
 
 		 613 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  34.8 
 
 		 608 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.22 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.86 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  33.12 
 
 		 611 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.25 
 
 		 661 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.84 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.84 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.22 
 
 		 590 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.5 
 
 		 595 aa  282  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.12 
 
 		 656 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.76 
 
 		 605 aa  278  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.76 
 
 		 605 aa  278  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  33.57 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.15 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  33.08 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.17 
 
 		 585 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  34.59 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  32.25 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.92 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.99 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.46 
 
 		 590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.75 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.45 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.41 
 
 		 649 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  32.14 
 
 		 601 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.7 
 
 		 597 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.58 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.74 
 
 		 595 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.56 
 
 		 595 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.43 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.56 
 
 		 623 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  30.78 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  28.65 
 
 		 583 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  29.88 
 
 		 569 aa  193  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.83 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  28.76 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.94 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.8 
 
 		 584 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.27 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.72 
 
 		 596 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.81 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.81 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.81 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>