More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1197 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.81 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.32 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.76 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.02 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  40.07 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.6 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.4 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  45.61 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.61 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.96 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.96 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.65 
 
 		 348 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.17 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.04 
 
 		 339 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  46.15 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.46 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.86 
 
 		 336 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.33 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.46 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.2 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.11 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.5 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  40.76 
 
 		 340 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.84 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.34 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  35.8 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.5 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.56 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.5 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.83 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.66 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.25 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  45.25 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  37.73 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.14 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  35.45 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.36 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.92 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.35 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  38.49 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.24 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  43.87 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.45 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  41.3 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  41.3 
 
 		 622 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.83 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  40.87 
 
 		 618 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.96 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.74 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.31 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.98 
 
 		 613 aa  158  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  40.87 
 
 		 618 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  44.79 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  43.52 
 
 		 618 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  43.06 
 
 		 618 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  43.52 
 
 		 618 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  43.52 
 
 		 618 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.92 
 
 		 615 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.92 
 
 		 615 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.92 
 
 		 615 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.27 
 
 		 615 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  43.06 
 
 		 618 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  39.92 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.41 
 
 		 616 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.82 
 
 		 614 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.31 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.47 
 
 		 615 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.93 
 
 		 617 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  39.68 
 
 		 273 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.36 
 
 		 614 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.01 
 
 		 605 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.01 
 
 		 605 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.36 
 
 		 614 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.91 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.11 
 
 		 637 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  42.86 
 
 		 616 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.36 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.55 
 
 		 587 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  39.67 
 
 		 616 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.18 
 
 		 613 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.91 
 
 		 614 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  42.25 
 
 		 616 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  40.45 
 
 		 612 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  42.25 
 
 		 616 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  40.08 
 
 		 394 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.05 
 
 		 383 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  42.38 
 
 		 616 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  41.99 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.64 
 
 		 613 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.42 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.25 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  40.45 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.97 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.37 
 
 		 617 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>