More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2179 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 299 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  57.79 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.06 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  51.32 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  50.88 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.65 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.7 
 
 		 348 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.57 
 
 		 270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  44.67 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.85 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  46.49 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.76 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.56 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.86 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.75 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  47.11 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.52 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.93 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.16 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  43.22 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.22 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.88 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.69 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.88 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.69 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.36 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  52.51 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  52.51 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  52.78 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  51.4 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.37 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.25 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.58 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  42.8 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.22 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  40 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.06 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.19 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  48.51 
 
 		 569 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.16 
 
 		 611 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.25 
 
 		 605 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.83 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.46 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  40.58 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  44.81 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  44.21 
 
 		 273 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  44.93 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  44.73 
 
 		 623 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.68 
 
 		 613 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.81 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.33 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  35.11 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.54 
 
 		 595 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.82 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.42 
 
 		 656 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  38.49 
 
 		 612 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.8 
 
 		 615 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.8 
 
 		 615 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.8 
 
 		 615 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.4 
 
 		 615 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  42.37 
 
 		 609 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  42.92 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.4 
 
 		 615 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.54 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.59 
 
 		 595 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 613 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.46 
 
 		 593 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.46 
 
 		 593 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  42.47 
 
 		 618 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.05 
 
 		 617 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  40.89 
 
 		 617 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  42.47 
 
 		 618 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  42.47 
 
 		 618 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  40.54 
 
 		 616 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  42.47 
 
 		 618 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.47 
 
 		 618 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  42.47 
 
 		 618 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  41.63 
 
 		 273 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  42.47 
 
 		 622 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.97 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.52 
 
 		 613 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.15 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  39.33 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.3 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  40.09 
 
 		 616 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.99 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38 
 
 		 614 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 614 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.9 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.3 
 
 		 831 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 614 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  42.37 
 
 		 621 aa  159  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.2 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.45 
 
 		 617 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.6 
 
 		 614 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.39 
 
 		 562 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  42.01 
 
 		 618 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.74 
 
 		 617 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>