More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1703 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
297 aa  594  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.78 
 
 
296 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  58.02 
 
 
280 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.52 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.05 
 
 
298 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.04 
 
 
383 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  45.9 
 
 
301 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.66 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.89 
 
 
296 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 
299 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  49.56 
 
 
316 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.88 
 
 
295 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.8 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.89 
 
 
382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.89 
 
 
382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.21 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.97 
 
 
290 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.75 
 
 
299 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.02 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.22 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.15 
 
 
339 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.23 
 
 
293 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.38 
 
 
313 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  36.49 
 
 
303 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.2 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.37 
 
 
293 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.01 
 
 
335 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.87 
 
 
274 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.92 
 
 
371 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  41.22 
 
 
340 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.16 
 
 
327 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.43 
 
 
336 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.91 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.61 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.61 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  38.37 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  39 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.4 
 
 
348 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.23 
 
 
313 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.48 
 
 
286 aa  158  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  49.1 
 
 
270 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.06 
 
 
605 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.44 
 
 
287 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.67 
 
 
287 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.55 
 
 
605 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.55 
 
 
605 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.83 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.26 
 
 
656 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  41.47 
 
 
273 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  39.55 
 
 
601 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  40.7 
 
 
272 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.24 
 
 
269 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  39.71 
 
 
273 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  43.75 
 
 
270 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.24 
 
 
269 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  44.64 
 
 
269 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.5 
 
 
269 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.34 
 
 
326 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  44.21 
 
 
270 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  37.45 
 
 
320 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.82 
 
 
298 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.64 
 
 
269 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.55 
 
 
597 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.15 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  33.04 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  47.83 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.69 
 
 
595 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.83 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.84 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  39.9 
 
 
608 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.4 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.46 
 
 
604 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.37 
 
 
325 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.91 
 
 
298 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.95 
 
 
321 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.9 
 
 
291 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  41.82 
 
 
394 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  37.61 
 
 
601 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.79 
 
 
626 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.35 
 
 
598 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.35 
 
 
598 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.99 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  35.89 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.88 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  35.89 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  36.33 
 
 
609 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.71 
 
 
640 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.36 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.05 
 
 
597 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.27 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  36.28 
 
 
583 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.21 
 
 
633 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  34.06 
 
 
410 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.02 
 
 
595 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.46 
 
 
617 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  40.21 
 
 
633 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.49 
 
 
629 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.13 
 
 
265 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.75 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>