More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3180 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.06 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.98 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.92 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  46.69 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.93 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.45 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.63 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.34 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.08 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  44.83 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  43.86 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.27 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.24 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.28 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  41.04 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.28 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.76 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.96 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.79 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  39.56 
 
 		 618 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.13 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  41.8 
 
 		 410 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  43.15 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.64 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.5 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.49 
 
 		 618 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.05 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  43.15 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.26 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  45.08 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  38.82 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.91 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.84 
 
 		 617 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.3 
 
 		 605 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  36.88 
 
 		 618 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  36.88 
 
 		 618 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  36.88 
 
 		 618 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  36.88 
 
 		 622 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  36.88 
 
 		 618 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.33 
 
 		 269 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.57 
 
 		 587 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  42.11 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.11 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  36.52 
 
 		 618 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.52 
 
 		 618 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.36 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  36.52 
 
 		 618 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  39.31 
 
 		 618 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.03 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.21 
 
 		 608 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.31 
 
 		 637 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  35.74 
 
 		 616 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  39.31 
 
 		 618 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  39.31 
 
 		 618 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  36.58 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.74 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  39.31 
 
 		 618 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  38.93 
 
 		 618 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.91 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 		 614 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 		 614 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 		 614 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  36.74 
 
 		 616 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 		 614 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.68 
 
 		 615 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.68 
 
 		 615 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.68 
 
 		 615 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.74 
 
 		 616 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  38.1 
 
 		 616 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  40.72 
 
 		 616 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  38.1 
 
 		 616 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  40.49 
 
 		 623 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.91 
 
 		 593 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.91 
 
 		 593 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  41.33 
 
 		 609 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  40.09 
 
 		 616 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.23 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  37.82 
 
 		 616 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.26 
 
 		 656 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.29 
 
 		 615 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.91 
 
 		 595 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.38 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.21 
 
 		 562 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  39.74 
 
 		 618 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  38.58 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.4 
 
 		 598 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.4 
 
 		 598 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  40.44 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.52 
 
 		 615 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  40.44 
 
 		 633 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.44 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.72 
 
 		 613 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38 
 
 		 589 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.3 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.3 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.93 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40 
 
 		 633 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.83 
 
 		 617 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>