More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2415 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.67 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.88 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.7 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  52.6 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.89 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.49 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.76 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.24 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.69 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  45.11 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.54 
 
 		 270 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.56 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.68 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.68 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.21 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  45.74 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.6 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  42.65 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.41 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.63 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  44.16 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  43.36 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.16 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.81 
 
 		 269 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.39 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.36 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.07 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.36 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.31 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.44 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.88 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  42.86 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.07 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  42.6 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  41.48 
 
 		 394 aa  168  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  43.05 
 
 		 273 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.41 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  41.74 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  42.29 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  44.19 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.53 
 
 		 587 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  37.07 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  36.3 
 
 		 623 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.61 
 
 		 563 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.82 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.32 
 
 		 593 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.32 
 
 		 593 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.04 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.89 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.08 
 
 		 324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.61 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.16 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43 
 
 		 614 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.15 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.48 
 
 		 614 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.48 
 
 		 614 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.48 
 
 		 614 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.26 
 
 		 595 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  41.98 
 
 		 410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  36.92 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.69 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.55 
 
 		 615 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.55 
 
 		 615 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.55 
 
 		 615 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.98 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.61 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.27 
 
 		 611 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.05 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.49 
 
 		 615 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.06 
 
 		 615 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.99 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.2 
 
 		 566 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.8 
 
 		 613 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  39.6 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.32 
 
 		 593 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  38.96 
 
 		 617 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 598 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 598 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.8 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  37.14 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.85 
 
 		 594 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.7 
 
 		 617 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  45.55 
 
 		 610 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.14 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40 
 
 		 595 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  36.12 
 
 		 609 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  39.15 
 
 		 569 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.91 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  38.6 
 
 		 608 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  41.36 
 
 		 612 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.75 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.17 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.02 
 
 		 649 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  39.3 
 
 		 616 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>