More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1916 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  100 
 
 
270 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  74.18 
 
 
273 aa  414  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  73.82 
 
 
273 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  73.63 
 
 
270 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  71.9 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  71.9 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  70.07 
 
 
272 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  70.29 
 
 
274 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  59.78 
 
 
270 aa  311  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  56.83 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  56.83 
 
 
269 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  57.2 
 
 
269 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  56.83 
 
 
269 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  53.7 
 
 
269 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  53.07 
 
 
269 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  57.56 
 
 
273 aa  284  9e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  53.33 
 
 
269 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  52.59 
 
 
269 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  50.75 
 
 
301 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.74 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.01 
 
 
371 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.81 
 
 
299 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.29 
 
 
295 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.93 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.52 
 
 
295 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.24 
 
 
298 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.15 
 
 
299 aa  171  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.93 
 
 
335 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  41.74 
 
 
297 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.36 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.73 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.88 
 
 
296 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.34 
 
 
290 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.82 
 
 
382 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.82 
 
 
382 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.71 
 
 
274 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  37.71 
 
 
316 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.12 
 
 
293 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.31 
 
 
336 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.3 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.45 
 
 
339 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.41 
 
 
366 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.91 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.75 
 
 
297 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.22 
 
 
348 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.96 
 
 
342 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.41 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.4 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.69 
 
 
291 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.8 
 
 
383 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  40.57 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.78 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  35.98 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  41.49 
 
 
623 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  39.38 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.8 
 
 
313 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40 
 
 
594 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.91 
 
 
593 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.91 
 
 
593 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  41.81 
 
 
289 aa  135  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.86 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.86 
 
 
593 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 
354 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  36.7 
 
 
593 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.96 
 
 
604 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.44 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.92 
 
 
590 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.05 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  36.6 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.78 
 
 
608 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.89 
 
 
649 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.61 
 
 
335 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.97 
 
 
321 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.87 
 
 
329 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  36.54 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.91 
 
 
319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  35.1 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  38.5 
 
 
569 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.38 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  38.64 
 
 
583 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.6 
 
 
587 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  34.87 
 
 
617 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.88 
 
 
595 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  35.71 
 
 
616 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.45 
 
 
351 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  41.55 
 
 
394 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.69 
 
 
613 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  36.71 
 
 
322 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
319 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.29 
 
 
286 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.27 
 
 
562 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.5 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.24 
 
 
831 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.69 
 
 
656 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.28 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.69 
 
 
633 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.27 
 
 
615 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.07 
 
 
323 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>