More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1739 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 319 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.03 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.34 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  46.58 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.99 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.05 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.68 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.33 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.37 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.59 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  37.84 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.96 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2985  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.05 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000162336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.43 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  40.61 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  40.51 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.76 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.85 
 
 		 605 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.44 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.86 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.2 
 
 		 563 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  36.33 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  38.73 
 
 		 569 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.61 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.13 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.1 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.1 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.13 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.51 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.29 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  33.84 
 
 		 618 aa  139  6e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.87 
 
 		 566 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.31 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.37 
 
 		 595 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.85 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.75 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.69 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.95 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.19 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.22 
 
 		 570 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.77 
 
 		 831 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.86 
 
 		 598 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.86 
 
 		 598 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.4 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.77 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.4 
 
 		 272 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  32.84 
 
 		 616 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  32.84 
 
 		 616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.95 
 
 		 587 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.02 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  37.38 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.17 
 
 		 562 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.1 
 
 		 616 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.49 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  31.54 
 
 		 618 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.03 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.71 
 
 		 608 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.84 
 
 		 617 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  36.64 
 
 		 618 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  34.88 
 
 		 623 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.82 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.01 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.2 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  32.17 
 
 		 583 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.05 
 
 		 626 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.43 
 
 		 656 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  34.88 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  36.21 
 
 		 622 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  36.21 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  36.21 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  36.21 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  36.21 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.21 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  36.21 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.97 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.78 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  38.83 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.2 
 
 		 651 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.19 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  31.43 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.68 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.41 
 
 		 590 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.05 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.74 
 
 		 269 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  38.2 
 
 		 270 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  33.33 
 
 		 270 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  38.03 
 
 		 616 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.21 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.23 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.36 
 
 		 875 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.19 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  38.71 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  36.2 
 
 		 621 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.4 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.77 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.55 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.93 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  35.8 
 
 		 618 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>