More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2095 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2095  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  58.53 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  42.53 
 
 
394 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  39.62 
 
 
410 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.19 
 
 
299 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.87 
 
 
313 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.92 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.4 
 
 
342 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.68 
 
 
296 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.99 
 
 
348 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  39.19 
 
 
297 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.34 
 
 
297 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.55 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.92 
 
 
290 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.17 
 
 
339 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  39.81 
 
 
316 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.55 
 
 
299 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.64 
 
 
587 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.02 
 
 
382 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.02 
 
 
382 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.75 
 
 
298 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.16 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.2 
 
 
327 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.52 
 
 
656 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.8 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.65 
 
 
371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  41.26 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  38.14 
 
 
608 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.05 
 
 
605 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.41 
 
 
598 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.41 
 
 
598 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.69 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.1 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  41.52 
 
 
280 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  37.25 
 
 
301 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.33 
 
 
611 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.99 
 
 
296 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.46 
 
 
590 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.22 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.94 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.71 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
272 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  37.02 
 
 
583 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.57 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  40.57 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  39.78 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.64 
 
 
649 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.82 
 
 
831 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.94 
 
 
595 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.29 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  36.42 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.2 
 
 
563 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.8 
 
 
613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.07 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.29 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  33.78 
 
 
569 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.98 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.08 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.9 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.59 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  35.84 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.86 
 
 
611 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.78 
 
 
324 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.04 
 
 
562 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  35.91 
 
 
621 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.41 
 
 
637 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.84 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.42 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  34.86 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.06 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  35.65 
 
 
616 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  37.71 
 
 
270 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.65 
 
 
613 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  34.1 
 
 
273 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.48 
 
 
615 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  34.74 
 
 
609 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.48 
 
 
615 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.48 
 
 
615 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 
614 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  35.35 
 
 
612 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.19 
 
 
613 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.43 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.92 
 
 
640 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.43 
 
 
319 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.48 
 
 
629 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.13 
 
 
313 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.91 
 
 
604 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  40.98 
 
 
609 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  32.69 
 
 
513 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.04 
 
 
615 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.82 
 
 
335 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  33.49 
 
 
617 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  36.7 
 
 
273 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.04 
 
 
614 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 
614 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.04 
 
 
614 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.81 
 
 
269 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  35.64 
 
 
269 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.4 
 
 
617 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>